More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3725 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 918 aa  1870    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  39.5 
 
 		 929 aa  607  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3882  TonB-dependent receptor plug  48.01 
 
 		 1027 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0857894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 955 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5066  TonB-dependent receptor plug  44.75 
 
 		 1001 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000778295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  49.75 
 
 		 971 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 958 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6142  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 857 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.283964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4133  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 850 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.882317  normal  0.0172602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 801 aa  127  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 893 aa  108  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1059 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 836 aa  98.6  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 828 aa  97.8  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 1084 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1059 aa  95.9  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1085 aa  92.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1046 aa  92  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1107 aa  91.3  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1081 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1100 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 1144 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1062 aa  89.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1028 aa  89  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1023 aa  89  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1079 aa  87.8  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 769 aa  87.4  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 1033 aa  85.9  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 759 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1173 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 854 aa  85.5  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1074 aa  84.7  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1043 aa  84.3  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 747 aa  84  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 1008 aa  83.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1036 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  29.45 
 
 		 1058 aa  83.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1027 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1153 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1076 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1079 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1051 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  31.49 
 
 		 807 aa  82.4  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1041 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 996 aa  82.4  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1040 aa  81.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  30.62 
 
 		 1030 aa  81.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1071 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1120 aa  80.9  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 996 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.47 
 
 		 1041 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 828 aa  80.1  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  34.7 
 
 		 1189 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1127 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  29.29 
 
 		 1025 aa  79.3  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1058 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1039 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1064 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1096 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1036 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 1010 aa  79  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  31.98 
 
 		 1035 aa  78.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 1161 aa  78.2  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1104 aa  78.2  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1063 aa  78.2  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1041 aa  78.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1060 aa  78.2  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 845 aa  78.2  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4224  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1063 aa  78.2  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1105 aa  78.2  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1019 aa  77.8  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1076 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 1056 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 1037 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1004 aa  77.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 1144 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 1002 aa  77  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1155 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1117 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1099 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 757 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1057 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1116 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1031 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1102 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1147 aa  75.5  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1062 aa  75.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1146 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1013 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1059 aa  75.5  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 979 aa  75.1  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 861 aa  75.1  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1008 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1070 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  34.96 
 
 		 1076 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1038 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1053 aa  74.7  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1099 aa  74.7  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 793 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1081 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>