More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5066 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3882  TonB-dependent receptor plug  58.64 
 
 		 1027 aa  1192    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0857894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5066  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1001 aa  2027    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000778295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  43.29 
 
 		 971 aa  558  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  45.23 
 
 		 918 aa  549  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 		 929 aa  542  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 958 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  39.61 
 
 		 955 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6142  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 857 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.283964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4133  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 850 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.882317  normal  0.0172602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 801 aa  149  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1074 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1064 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1107 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 1057 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1085 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1064 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1095 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 1083 aa  86.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1079 aa  86.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1023 aa  85.5  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 1088 aa  85.5  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1082 aa  85.5  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1096 aa  85.1  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 748 aa  84.7  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1070 aa  84.7  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1051 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1084 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 753 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  30.45 
 
 		 1058 aa  82.8  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 855 aa  82.4  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 1102 aa  82  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1071 aa  82  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1062 aa  81.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1046 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1115 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1019 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  22.9 
 
 		 814 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 893 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1117 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 769 aa  79.3  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 999 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1137 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 1064 aa  79.3  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1073 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  28.95 
 
 		 848 aa  78.2  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1104 aa  78.2  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1186 aa  78.2  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1027 aa  78.2  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1059 aa  78.2  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1095 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 1063 aa  77.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1021 aa  77.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1043 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1114 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1137 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1059 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 776 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1148 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 861 aa  75.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 795 aa  75.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 1105 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 1144 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 760 aa  75.1  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 1047 aa  74.7  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1006 aa  74.7  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 747 aa  74.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 1050 aa  74.3  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1084 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 1093 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 873 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1128 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  27.27 
 
 		 750 aa  73.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1038 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1043 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1127 aa  73.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1142 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1036 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1008 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1068 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1081 aa  73.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1047 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  23.87 
 
 		 824 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1077 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 828 aa  72.4  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1143 aa  72.4  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 987 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 854 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 779 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1065 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1119 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1142 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 754 aa  71.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1099 aa  71.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1010 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 1144 aa  72  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1148 aa  71.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1031 aa  71.2  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1099 aa  71.2  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1028 aa  71.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1034 aa  71.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>