171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4133 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6142  TonB-dependent receptor  52.82 
 
 		 857 aa  924    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.283964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4133  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 850 aa  1747    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.882317  normal  0.0172602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  42.11 
 
 		 958 aa  652    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 929 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 918 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3882  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1027 aa  324  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0857894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 955 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5066  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1001 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000778295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 971 aa  233  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 801 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 893 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 748 aa  65.1  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  32 
 
 		 750 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  30.43 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  29.89 
 
 		 646 aa  60.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  29.12 
 
 		 712 aa  59.7  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  23.08 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 715 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 678 aa  58.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  23.57 
 
 		 691 aa  58.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 736 aa  58.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 753 aa  57.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.78 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.97 
 
 		 639 aa  57  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 873 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 647 aa  57  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  33.11 
 
 		 653 aa  57  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 643 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 760 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 695 aa  56.2  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  28.83 
 
 		 718 aa  55.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  29.1 
 
 		 642 aa  55.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  28.79 
 
 		 690 aa  54.7  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 656 aa  54.3  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  23.5 
 
 		 687 aa  53.9  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  29.27 
 
 		 702 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  26.37 
 
 		 693 aa  53.9  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 710 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 775 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 653 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 700 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 792 aa  52.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 687 aa  52.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  30.43 
 
 		 718 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 655 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 684 aa  52.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 652 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 817 aa  51.6  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  27.56 
 
 		 670 aa  51.6  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  25.95 
 
 		 676 aa  51.6  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 653 aa  51.6  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 737 aa  51.6  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 690 aa  51.2  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 653 aa  51.6  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 708 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 665 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 690 aa  51.2  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 728 aa  51.2  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 728 aa  51.2  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 698 aa  50.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 680 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 776 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 764 aa  50.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 653 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 670 aa  50.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 727 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 645 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 653 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 695 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 747 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 783 aa  49.3  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1000 aa  49.3  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 784 aa  49.3  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 665 aa  49.3  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 649 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 828 aa  48.9  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 653 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 733 aa  48.5  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 686 aa  48.5  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  27.08 
 
 		 633 aa  48.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 688 aa  48.1  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 738 aa  48.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  27.78 
 
 		 661 aa  48.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 718 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 720 aa  48.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 836 aa  48.1  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 722 aa  47.8  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 796 aa  47.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 742 aa  47.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 701 aa  47.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 851 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  28.08 
 
 		 733 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 729 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 855 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 701 aa  47.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 730 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 795 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1445  TonB-dependent receptor, plug  26.52 
 
 		 825 aa  47  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000476077  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 738 aa  46.6  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  27.22 
 
 		 704 aa  46.6  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>