More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_26420 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  66.48 
 
 		 728 aa  966    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  60.45 
 
 		 739 aa  873    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  61.99 
 
 		 708 aa  895    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  67.59 
 
 		 708 aa  985    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  66.9 
 
 		 742 aa  974    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  62.2 
 
 		 746 aa  872    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  67.32 
 
 		 723 aa  985    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 		 718 aa  1462    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  96.25 
 
 		 720 aa  1409    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  44.9 
 
 		 704 aa  588  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  44.83 
 
 		 755 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  42.54 
 
 		 707 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  43.44 
 
 		 705 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  42.68 
 
 		 707 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  43.1 
 
 		 705 aa  561  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  43.94 
 
 		 738 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  43.05 
 
 		 776 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  44.28 
 
 		 689 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  43.71 
 
 		 696 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  43.71 
 
 		 696 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  43.71 
 
 		 696 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  42.07 
 
 		 822 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  43.24 
 
 		 756 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  43 
 
 		 756 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  43 
 
 		 756 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  43 
 
 		 756 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  43.24 
 
 		 820 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  43 
 
 		 756 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  43.44 
 
 		 756 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  42.6 
 
 		 758 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  44.83 
 
 		 712 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  43.13 
 
 		 701 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  43.37 
 
 		 690 aa  531  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  44.31 
 
 		 747 aa  524  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  44.31 
 
 		 747 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  43.86 
 
 		 747 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  42.64 
 
 		 727 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  43.86 
 
 		 770 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  40.92 
 
 		 721 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  39.94 
 
 		 703 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  36.25 
 
 		 703 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  36.53 
 
 		 720 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 717 aa  333  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 		 717 aa  325  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  33.7 
 
 		 716 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 		 728 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  33.56 
 
 		 784 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  34.15 
 
 		 730 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  33.74 
 
 		 730 aa  318  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 		 749 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 710 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 726 aa  274  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 724 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 735 aa  270  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 779 aa  267  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 		 721 aa  259  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  27.51 
 
 		 797 aa  226  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  25.38 
 
 		 813 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  27.31 
 
 		 737 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  36.27 
 
 		 399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 707 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 710 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 710 aa  177  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 770 aa  177  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 738 aa  168  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  27.1 
 
 		 527 aa  167  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 742 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 742 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 737 aa  164  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1503  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 643 aa  164  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 748 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 694 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 719 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 748 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 749 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 864 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 806 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 720 aa  160  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.31 
 
 		 708 aa  160  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 740 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  26.89 
 
 		 680 aa  160  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  24.22 
 
 		 729 aa  158  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 708 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 711 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.47 
 
 		 601 aa  156  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 715 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 696 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.29 
 
 		 696 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.82 
 
 		 703 aa  154  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 700 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 709 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  24.49 
 
 		 779 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 708 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 757 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 705 aa  151  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 701 aa  151  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  25.11 
 
 		 728 aa  151  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  27.01 
 
 		 752 aa  151  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  23.8 
 
 		 709 aa  151  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.68 
 
 		 711 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>