More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0411 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  48.55 
 
 		 770 aa  669    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  48.67 
 
 		 747 aa  672    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  50.51 
 
 		 747 aa  667    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  49.48 
 
 		 727 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  65.66 
 
 		 755 aa  999    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  53.93 
 
 		 738 aa  728    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  48.81 
 
 		 721 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  81.44 
 
 		 776 aa  1259    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  48.57 
 
 		 690 aa  636    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  54.41 
 
 		 705 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 758 aa  1538    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  48.63 
 
 		 747 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  47.82 
 
 		 705 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  48.27 
 
 		 707 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  48.12 
 
 		 707 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  45.89 
 
 		 704 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  46.18 
 
 		 689 aa  601  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  45.47 
 
 		 696 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  44.44 
 
 		 756 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  44.15 
 
 		 820 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  44.01 
 
 		 756 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  44.87 
 
 		 701 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  44.58 
 
 		 756 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  44.43 
 
 		 756 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  44.43 
 
 		 756 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  43.98 
 
 		 822 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  44.58 
 
 		 696 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  44.43 
 
 		 756 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  44.58 
 
 		 696 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  44.78 
 
 		 712 aa  550  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  42.75 
 
 		 720 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  42.6 
 
 		 718 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  42.08 
 
 		 708 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  42.94 
 
 		 708 aa  538  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  41.13 
 
 		 728 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  40.99 
 
 		 742 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  40.89 
 
 		 723 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  42.03 
 
 		 746 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  41.36 
 
 		 703 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  41.61 
 
 		 739 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  37.16 
 
 		 703 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  36.56 
 
 		 720 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  35.3 
 
 		 716 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  34.19 
 
 		 730 aa  350  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  33.62 
 
 		 730 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 		 710 aa  340  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  33.9 
 
 		 717 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 749 aa  330  6e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 		 724 aa  327  7e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 717 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 726 aa  321  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 735 aa  315  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 		 728 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  31.68 
 
 		 784 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 		 779 aa  289  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  30.78 
 
 		 797 aa  283  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  29.22 
 
 		 813 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 721 aa  272  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 737 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  29.55 
 
 		 527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.57 
 
 		 601 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 779 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 860 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1503  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 643 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 727 aa  157  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 797 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 711 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 749 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  25.13 
 
 		 748 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  25.13 
 
 		 748 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 711 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 789 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 707 aa  154  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 715 aa  154  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 738 aa  154  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 710 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 776 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 744 aa  153  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 740 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 770 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 815 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 710 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 744 aa  152  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 837 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 757 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 694 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 709 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 831 aa  148  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  25.47 
 
 		 711 aa  148  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 701 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 737 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 724 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 705 aa  144  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 745 aa  144  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 700 aa  144  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 732 aa  144  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 753 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  25.07 
 
 		 693 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 789 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>