More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5560 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  55.6 
 
 		 728 aa  797    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  56.69 
 
 		 746 aa  793    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 739 aa  1515    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  55.74 
 
 		 742 aa  805    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  60.73 
 
 		 720 aa  880    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  67.61 
 
 		 708 aa  995    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  56.1 
 
 		 708 aa  809    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  60.45 
 
 		 718 aa  873    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  56.29 
 
 		 723 aa  807    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  45.07 
 
 		 704 aa  588  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  42.12 
 
 		 689 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  44.31 
 
 		 696 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  41.5 
 
 		 705 aa  548  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  40.81 
 
 		 707 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  40.95 
 
 		 707 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  42.66 
 
 		 755 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  42.98 
 
 		 701 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  42.27 
 
 		 756 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  42.27 
 
 		 756 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  41.23 
 
 		 822 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  42.27 
 
 		 756 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  42.63 
 
 		 696 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  42.63 
 
 		 696 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  41.97 
 
 		 756 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  42.12 
 
 		 756 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  43.2 
 
 		 712 aa  530  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  41.97 
 
 		 820 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  42.27 
 
 		 756 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  41.26 
 
 		 705 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  41.7 
 
 		 738 aa  521  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  41.43 
 
 		 747 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  42.02 
 
 		 776 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  41.28 
 
 		 747 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  41.28 
 
 		 770 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  41.28 
 
 		 747 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  41.49 
 
 		 727 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  42.09 
 
 		 758 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  39.49 
 
 		 690 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  38.54 
 
 		 721 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  38.3 
 
 		 703 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  36.16 
 
 		 703 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 		 720 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 716 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  34.36 
 
 		 717 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 728 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 717 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 710 aa  317  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  32.5 
 
 		 784 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 		 749 aa  312  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 724 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  31.93 
 
 		 730 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  31.79 
 
 		 730 aa  300  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 735 aa  293  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 721 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 		 726 aa  285  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  27.39 
 
 		 813 aa  236  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 779 aa  234  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  27.3 
 
 		 797 aa  232  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  26.62 
 
 		 737 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  34.22 
 
 		 399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 710 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 770 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 719 aa  173  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 710 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  25.55 
 
 		 747 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1503  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 643 aa  167  9e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  25.45 
 
 		 747 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  25.55 
 
 		 747 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  24.87 
 
 		 752 aa  165  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.49 
 
 		 601 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  25.75 
 
 		 747 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.3 
 
 		 703 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.3 
 
 		 708 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  25.39 
 
 		 745 aa  161  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 707 aa  160  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 700 aa  160  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  25.42 
 
 		 747 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 747 aa  159  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 829 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  25.19 
 
 		 747 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 689 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 864 aa  157  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  25 
 
 		 728 aa  157  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 797 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  25.19 
 
 		 747 aa  156  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 797 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 797 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  25.56 
 
 		 711 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  25.25 
 
 		 729 aa  154  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  25.75 
 
 		 680 aa  154  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 778 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 699 aa  153  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 696 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 689 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 701 aa  152  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 860 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 797 aa  151  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  24.5 
 
 		 729 aa  151  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 703 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.74 
 
 		 696 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>