More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3318 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  55.59 
 
 		 728 aa  800    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  55.77 
 
 		 784 aa  798    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  56.17 
 
 		 716 aa  814    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 710 aa  1462    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  56.29 
 
 		 749 aa  768    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  55.86 
 
 		 717 aa  807    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  63.11 
 
 		 730 aa  926    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  63.8 
 
 		 730 aa  933    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  56.83 
 
 		 717 aa  805    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  44.8 
 
 		 726 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  44.38 
 
 		 735 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  41.95 
 
 		 724 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 		 707 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 		 707 aa  360  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  49.6 
 
 		 399 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  34.9 
 
 		 705 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 776 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 		 689 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 		 755 aa  349  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 		 704 aa  340  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 738 aa  340  7e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 758 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 		 705 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 708 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 703 aa  332  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 		 742 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 		 708 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 		 696 aa  327  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  31.97 
 
 		 723 aa  325  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 728 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 739 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  34.38 
 
 		 747 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  34.53 
 
 		 747 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 		 712 aa  313  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 770 aa  313  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 718 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 703 aa  310  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 701 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 747 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 		 690 aa  308  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 720 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 721 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 		 696 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 		 696 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.47 
 
 		 822 aa  301  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 		 727 aa  299  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 756 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.18 
 
 		 756 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 756 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 756 aa  294  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  30.37 
 
 		 756 aa  294  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.23 
 
 		 820 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 746 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 756 aa  291  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 779 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 720 aa  269  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 737 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  30.51 
 
 		 797 aa  260  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 721 aa  241  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  28.13 
 
 		 813 aa  239  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 710 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 770 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 710 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 719 aa  170  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  27.25 
 
 		 527 aa  167  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 773 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 707 aa  164  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 792 aa  163  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.82 
 
 		 703 aa  162  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 760 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.48 
 
 		 708 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.1 
 
 		 703 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 768 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.7 
 
 		 601 aa  157  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 766 aa  157  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  25.24 
 
 		 753 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 757 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 709 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 700 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 730 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 701 aa  152  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 780 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 730 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 710 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 730 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 730 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 731 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 731 aa  147  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 731 aa  147  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 706 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 706 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 703 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 747 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 784 aa  144  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 763 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  23.85 
 
 		 736 aa  144  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  24.96 
 
 		 695 aa  143  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.87 
 
 		 833 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 797 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 797 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>