More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3462 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  50.44 
 
 		 737 aa  676    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  69.7 
 
 		 813 aa  1105    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  100 
 
 		 797 aa  1612    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 758 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 		 704 aa  288  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 707 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 707 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 705 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 755 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 689 aa  274  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 779 aa  272  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  30.91 
 
 		 716 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 		 770 aa  272  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 776 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 747 aa  269  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 747 aa  262  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  30.43 
 
 		 784 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  30.69 
 
 		 747 aa  260  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 710 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 705 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 727 aa  257  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  30.37 
 
 		 730 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 717 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  30.37 
 
 		 730 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 738 aa  253  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 721 aa  253  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 696 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 708 aa  250  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 724 aa  248  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  29.7 
 
 		 726 aa  247  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 		 690 aa  246  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 717 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 728 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 708 aa  240  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 735 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 746 aa  239  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  27.28 
 
 		 728 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 742 aa  237  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 756 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 703 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  28.97 
 
 		 822 aa  234  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  29.54 
 
 		 820 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 756 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 739 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  29.54 
 
 		 756 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  27.28 
 
 		 723 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 756 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  29.31 
 
 		 756 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 756 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 		 696 aa  230  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 		 696 aa  230  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 703 aa  228  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 712 aa  228  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 721 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 718 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 720 aa  226  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 701 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 749 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 720 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  30.57 
 
 		 527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.6 
 
 		 601 aa  152  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 707 aa  124  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 710 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  25.21 
 
 		 680 aa  121  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 770 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 710 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 715 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  23.64 
 
 		 734 aa  114  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  23.16 
 
 		 700 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 694 aa  111  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 708 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  22.25 
 
 		 689 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 744 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 		 698 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  22.99 
 
 		 744 aa  108  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  21.97 
 
 		 689 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 705 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.55 
 
 		 709 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.89 
 
 		 703 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  25.43 
 
 		 757 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 792 aa  105  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 		 753 aa  104  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 748 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 748 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  23.85 
 
 		 754 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.18 
 
 		 724 aa  104  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  23.88 
 
 		 721 aa  104  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 778 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  22.73 
 
 		 745 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 766 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  23.51 
 
 		 711 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  23.8 
 
 		 740 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  22.98 
 
 		 719 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 820 aa  101  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 743 aa  100  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  23.95 
 
 		 708 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  22.81 
 
 		 696 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 399 aa  100  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 749 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 732 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>