More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0831 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  48.81 
 
 		 758 aa  641    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  56.38 
 
 		 770 aa  740    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  50.37 
 
 		 755 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  56.39 
 
 		 727 aa  780    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  50 
 
 		 776 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  56.23 
 
 		 747 aa  745    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  56.23 
 
 		 747 aa  737    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  54.63 
 
 		 738 aa  744    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 721 aa  1417    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  55.93 
 
 		 747 aa  740    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  76.06 
 
 		 705 aa  1092    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  46.75 
 
 		 690 aa  598  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  45.58 
 
 		 707 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  45.73 
 
 		 707 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  46 
 
 		 704 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  45.66 
 
 		 705 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  45.51 
 
 		 689 aa  564  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  46.63 
 
 		 701 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  46.63 
 
 		 696 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  46.63 
 
 		 696 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  46.03 
 
 		 696 aa  548  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  46.63 
 
 		 756 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  46.63 
 
 		 820 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  46.63 
 
 		 756 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  46.78 
 
 		 756 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  46.48 
 
 		 756 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  46.63 
 
 		 756 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  46.48 
 
 		 756 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  46.03 
 
 		 822 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  40.85 
 
 		 720 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  40.4 
 
 		 718 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  39.09 
 
 		 708 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  40.39 
 
 		 708 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 742 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 728 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  41.96 
 
 		 712 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  38.79 
 
 		 723 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  37.85 
 
 		 739 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  42.01 
 
 		 703 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  40.45 
 
 		 746 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  37.67 
 
 		 720 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  36.7 
 
 		 703 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 726 aa  330  7e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 		 716 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 724 aa  320  7e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  33.65 
 
 		 717 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  32.62 
 
 		 749 aa  313  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 		 710 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  33.83 
 
 		 730 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  33.96 
 
 		 730 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 		 717 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  32.74 
 
 		 728 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  33.19 
 
 		 784 aa  293  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 735 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 721 aa  263  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  29.64 
 
 		 813 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  31.12 
 
 		 737 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 779 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  28.85 
 
 		 797 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 399 aa  180  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 701 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 701 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 831 aa  161  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 701 aa  160  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 701 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.73 
 
 		 601 aa  158  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 709 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 757 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 701 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 701 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 719 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 726 aa  153  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 770 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 710 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 710 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 829 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 711 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.18 
 
 		 801 aa  147  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.65 
 
 		 695 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 727 aa  147  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 707 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 744 aa  146  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  29.27 
 
 		 527 aa  146  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 755 aa  146  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 789 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 744 aa  144  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 706 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 706 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 864 aa  144  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 723 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  24.86 
 
 		 703 aa  142  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 860 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 757 aa  141  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 		 701 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.28 
 
 		 718 aa  140  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  24.33 
 
 		 729 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 743 aa  138  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 719 aa  138  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 771 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 862 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>