More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3193 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  100 
 
 
756 aa  1502    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  99.07 
 
 
756 aa  1487    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  98.94 
 
 
756 aa  1491    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  99.07 
 
 
756 aa  1487    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  98.94 
 
 
756 aa  1488    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  99.34 
 
 
820 aa  1493    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  69.63 
 
 
696 aa  971    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  48.12 
 
 
705 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  93.26 
 
 
822 aa  1394    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  68.89 
 
 
701 aa  960    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  68.59 
 
 
696 aa  947    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  47.16 
 
 
707 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  99.07 
 
 
756 aa  1487    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  68.59 
 
 
696 aa  947    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  47.3 
 
 
707 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  44.88 
 
 
758 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  44.17 
 
 
776 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  45.62 
 
 
755 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  44.76 
 
 
689 aa  575  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  44.93 
 
 
704 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  42.92 
 
 
708 aa  559  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  46.98 
 
 
705 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  42.03 
 
 
718 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  43.01 
 
 
720 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  42.39 
 
 
708 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  43.22 
 
 
746 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  41.09 
 
 
739 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  42.53 
 
 
742 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  42.06 
 
 
728 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  46.48 
 
 
721 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  40.95 
 
 
723 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  42.23 
 
 
738 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  43.52 
 
 
770 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  43.22 
 
 
747 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  42.5 
 
 
747 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  42.64 
 
 
747 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  41.7 
 
 
712 aa  486  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  41.92 
 
 
690 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  42.6 
 
 
727 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  42.63 
 
 
703 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  38.68 
 
 
720 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 
703 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 
716 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 
717 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  31.66 
 
 
749 aa  296  9e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  31.13 
 
 
730 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 
710 aa  294  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  31 
 
 
730 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 
728 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
717 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  30.56 
 
 
784 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 
724 aa  276  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 
721 aa  251  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 
726 aa  250  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
779 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 
735 aa  243  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  31.01 
 
 
737 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  29.78 
 
 
797 aa  232  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  27.73 
 
 
813 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 
399 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 
797 aa  172  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.99 
 
 
718 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 
778 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 
719 aa  156  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 
723 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 
757 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 
527 aa  154  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.9 
 
 
833 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 
709 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 
799 aa  153  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 
733 aa  151  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.09 
 
 
601 aa  151  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 
701 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  25.24 
 
 
752 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 
829 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 
701 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 
701 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 
712 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 
828 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 
828 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 
749 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 
745 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 
715 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 
831 aa  142  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 
730 aa  141  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  25.04 
 
 
745 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  24.61 
 
 
747 aa  140  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 
850 aa  140  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  24.14 
 
 
747 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 
711 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 
707 aa  140  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 
779 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  24.61 
 
 
747 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  24.61 
 
 
747 aa  140  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  24.05 
 
 
729 aa  139  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 
797 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  22.69 
 
 
700 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 
863 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  24.11 
 
 
699 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  23.41 
 
 
689 aa  138  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>