More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4740 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 726 aa  1469    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  67.39 
 
 		 735 aa  945    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  68.25 
 
 		 724 aa  977    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  47.31 
 
 		 730 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  48.6 
 
 		 730 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  44.31 
 
 		 749 aa  588  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  44.8 
 
 		 710 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  44.32 
 
 		 717 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  44.18 
 
 		 717 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  43.49 
 
 		 728 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  43.68 
 
 		 716 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  43.33 
 
 		 784 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 		 703 aa  350  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 		 755 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 707 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  34.25 
 
 		 705 aa  332  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 		 705 aa  330  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  33.15 
 
 		 738 aa  330  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 707 aa  329  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 704 aa  326  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  35.35 
 
 		 721 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 		 776 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 758 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  34.89 
 
 		 770 aa  320  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 689 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  34.61 
 
 		 747 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 747 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  34.61 
 
 		 747 aa  313  9e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 742 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 728 aa  311  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 723 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 		 708 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 690 aa  297  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 		 708 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 727 aa  296  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  32.66 
 
 		 746 aa  291  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 696 aa  287  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 739 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 701 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  31.56 
 
 		 737 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 712 aa  282  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 720 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 718 aa  279  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 696 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 696 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 703 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 779 aa  260  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 756 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.61 
 
 		 756 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 756 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 756 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 756 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  30.61 
 
 		 756 aa  251  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.61 
 
 		 820 aa  251  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.35 
 
 		 822 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  30.11 
 
 		 797 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  30.11 
 
 		 813 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 721 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 		 720 aa  244  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 399 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.26 
 
 		 601 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 727 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 706 aa  165  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 706 aa  165  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  28.1 
 
 		 527 aa  158  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 719 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 710 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.35 
 
 		 695 aa  147  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 770 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 700 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 710 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 792 aa  144  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 707 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 713 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 712 aa  138  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  23.4 
 
 		 716 aa  135  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 860 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  24.75 
 
 		 729 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 747 aa  132  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 769 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  24.7 
 
 		 680 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 718 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  23.93 
 
 		 711 aa  127  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 724 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 715 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 712 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 689 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 715 aa  124  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1503  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 643 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 819 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 749 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 757 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 745 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 768 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 850 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 776 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 734 aa  122  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 694 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 750 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 		 828 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>