More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0594 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  61.63 
 
 		 728 aa  871    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  61.77 
 
 		 742 aa  874    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  61.18 
 
 		 708 aa  880    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  67.61 
 
 		 739 aa  995    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 708 aa  1448    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  60.32 
 
 		 723 aa  857    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  60 
 
 		 746 aa  841    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  62.13 
 
 		 720 aa  905    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  61.99 
 
 		 718 aa  895    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  45.42 
 
 		 689 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  45.05 
 
 		 704 aa  601  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  44.93 
 
 		 755 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  43.78 
 
 		 696 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  43.7 
 
 		 705 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  42.88 
 
 		 707 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  43.02 
 
 		 707 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  44.36 
 
 		 701 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  42.92 
 
 		 756 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  44.06 
 
 		 696 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  44.06 
 
 		 696 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  43.07 
 
 		 756 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  43.07 
 
 		 756 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  42.92 
 
 		 820 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  43.21 
 
 		 822 aa  558  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  43.07 
 
 		 756 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  42.92 
 
 		 756 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  43.07 
 
 		 756 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  42.79 
 
 		 776 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  43.43 
 
 		 738 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  43.47 
 
 		 712 aa  547  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  41.85 
 
 		 705 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  43.54 
 
 		 747 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  43.54 
 
 		 747 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  43.24 
 
 		 770 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  43.2 
 
 		 758 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  43.24 
 
 		 747 aa  534  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  41.03 
 
 		 727 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  41.58 
 
 		 690 aa  514  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  40.21 
 
 		 721 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  38.49 
 
 		 703 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  35.63 
 
 		 703 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 720 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  36.05 
 
 		 716 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  35.86 
 
 		 717 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  35.34 
 
 		 749 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  34.2 
 
 		 717 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 		 728 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  35.2 
 
 		 730 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  34.64 
 
 		 730 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 710 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  33.11 
 
 		 784 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 724 aa  309  9e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 726 aa  294  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 721 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 735 aa  282  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 779 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  28.73 
 
 		 797 aa  250  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  27.92 
 
 		 737 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  26.75 
 
 		 813 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 		 399 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 710 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 770 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 710 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  27.08 
 
 		 703 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.08 
 
 		 708 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 792 aa  177  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 719 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1503  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 643 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 689 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 699 aa  173  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  27.26 
 
 		 728 aa  173  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 700 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 828 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 689 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 707 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  28.25 
 
 		 527 aa  170  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 829 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 724 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 724 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 705 aa  167  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.19 
 
 		 601 aa  167  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 831 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 701 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 701 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 701 aa  165  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 720 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 701 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 714 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 864 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 712 aa  164  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 701 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 720 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 720 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 797 aa  163  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 779 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 778 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 720 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 701 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 723 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>