More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4827 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 690 aa  1393    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  50 
 
 		 755 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  48.57 
 
 		 758 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  49.32 
 
 		 776 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  48.21 
 
 		 705 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  45.17 
 
 		 738 aa  616  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  46.87 
 
 		 721 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  45.19 
 
 		 689 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  46.2 
 
 		 747 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  43.89 
 
 		 770 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  46.05 
 
 		 747 aa  567  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  45.75 
 
 		 747 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  44.99 
 
 		 705 aa  558  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  44.68 
 
 		 707 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  44.26 
 
 		 707 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  42.96 
 
 		 727 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  43.56 
 
 		 718 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  43.22 
 
 		 720 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  40.4 
 
 		 704 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  43.15 
 
 		 712 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  41.6 
 
 		 708 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  43.36 
 
 		 696 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  41.65 
 
 		 746 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  39.49 
 
 		 739 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  42.44 
 
 		 701 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  41.46 
 
 		 708 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  42.6 
 
 		 696 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  42.6 
 
 		 696 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  40.4 
 
 		 742 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  40.85 
 
 		 728 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  39.39 
 
 		 723 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  41.92 
 
 		 756 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  42.07 
 
 		 756 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  41.86 
 
 		 822 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  41.92 
 
 		 756 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  41.77 
 
 		 820 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  41.92 
 
 		 756 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  41.92 
 
 		 756 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  41.62 
 
 		 756 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  39.43 
 
 		 703 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 		 703 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  35.86 
 
 		 720 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 724 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  34.45 
 
 		 730 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  32.63 
 
 		 716 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  34.17 
 
 		 730 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 		 710 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 		 717 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 735 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  32.96 
 
 		 749 aa  300  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 726 aa  299  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 728 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 717 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 721 aa  281  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  29.67 
 
 		 813 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  32.01 
 
 		 784 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  30.4 
 
 		 797 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 779 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  29.13 
 
 		 737 aa  246  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 711 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 740 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 742 aa  180  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 748 aa  180  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 748 aa  180  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 738 aa  180  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 742 aa  176  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 737 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 749 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 399 aa  174  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 795 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  26.12 
 
 		 716 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 710 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 794 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 770 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 710 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 707 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 715 aa  161  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 792 aa  160  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 828 aa  160  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 820 aa  160  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 718 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 731 aa  160  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.88 
 
 		 601 aa  158  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 701 aa  157  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 797 aa  157  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 700 aa  157  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 776 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 828 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 828 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 850 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 723 aa  154  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 719 aa  154  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 727 aa  153  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 689 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 825 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.76 
 
 		 833 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 825 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 		 527 aa  150  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 708 aa  150  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 747 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>