More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2318 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 779 aa  1575    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  81.87 
 
 		 527 aa  880    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  45.37 
 
 		 601 aa  364  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 755 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  32.41 
 
 		 704 aa  328  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 		 707 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 703 aa  313  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 707 aa  312  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  31.18 
 
 		 689 aa  307  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 705 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  32.05 
 
 		 737 aa  300  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  32.31 
 
 		 712 aa  298  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 		 776 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 703 aa  290  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 716 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 758 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 696 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 710 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  28.29 
 
 		 813 aa  274  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 717 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  31.57 
 
 		 705 aa  273  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 708 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 728 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 728 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 749 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 717 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 718 aa  267  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 723 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 738 aa  266  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  29.18 
 
 		 730 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  29.29 
 
 		 730 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  28.97 
 
 		 784 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 742 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 735 aa  263  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  29.16 
 
 		 797 aa  263  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 696 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 696 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 708 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 726 aa  260  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 		 701 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 724 aa  253  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 720 aa  253  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 727 aa  252  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  29.99 
 
 		 822 aa  250  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 747 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  30.4 
 
 		 770 aa  249  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 721 aa  249  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 720 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 747 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  29.72 
 
 		 820 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  30 
 
 		 756 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 756 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 690 aa  244  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.12 
 
 		 756 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 756 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 756 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 747 aa  242  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 756 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 746 aa  239  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 739 aa  233  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 721 aa  200  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 710 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 770 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 710 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.31 
 
 		 833 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 843 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  25.51 
 
 		 729 aa  167  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 710 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 769 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 863 aa  160  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 708 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 730 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 797 aa  157  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 862 aa  157  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 755 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  24.47 
 
 		 729 aa  155  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 710 aa  154  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  24.3 
 
 		 703 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  24.3 
 
 		 703 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 713 aa  153  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  24.34 
 
 		 729 aa  153  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 708 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 743 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 710 aa  153  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  24.17 
 
 		 729 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 791 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  24.24 
 
 		 729 aa  152  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 864 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 766 aa  152  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 817 aa  150  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  25.72 
 
 		 791 aa  150  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  25.21 
 
 		 715 aa  150  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 711 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 706 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 837 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 726 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 726 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 706 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  23.93 
 
 		 716 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 828 aa  149  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>