More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3326 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  50.44 
 
 		 797 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  48.4 
 
 		 813 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 737 aa  1472    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 704 aa  313  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 779 aa  301  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 689 aa  292  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 		 721 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 724 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 		 705 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 726 aa  281  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 755 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 716 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 735 aa  270  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 710 aa  263  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  32.48 
 
 		 703 aa  260  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 747 aa  257  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 705 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 696 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 712 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 707 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 707 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 747 aa  251  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 770 aa  250  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 738 aa  249  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 747 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  29.85 
 
 		 730 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 708 aa  247  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 776 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 690 aa  246  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 721 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 703 aa  244  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 727 aa  245  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  29.56 
 
 		 730 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 696 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 696 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 728 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 749 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 		 720 aa  241  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.87 
 
 		 822 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 		 758 aa  237  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 701 aa  237  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 717 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  31.01 
 
 		 756 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 756 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 756 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 742 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 717 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.87 
 
 		 820 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.87 
 
 		 756 aa  234  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 756 aa  234  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 756 aa  234  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 708 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 728 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 723 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  28.46 
 
 		 784 aa  231  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 746 aa  225  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 739 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 718 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 720 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 527 aa  210  8e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.81 
 
 		 601 aa  158  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 689 aa  147  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 689 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.2 
 
 		 698 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 792 aa  138  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  24.93 
 
 		 695 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  23.41 
 
 		 776 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 700 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  23.38 
 
 		 710 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 770 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 710 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 715 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 744 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  23.23 
 
 		 795 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 718 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 744 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 710 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  23.14 
 
 		 706 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  23.14 
 
 		 706 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 764 aa  124  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 696 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 757 aa  123  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 749 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 712 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.03 
 
 		 696 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 747 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.57 
 
 		 724 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 831 aa  118  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 753 aa  119  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 791 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  25.62 
 
 		 791 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  24.17 
 
 		 769 aa  114  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 794 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 810 aa  111  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 753 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 778 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  25.23 
 
 		 680 aa  110  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 799 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 733 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.4 
 
 		 709 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>