More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2412 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  91.77 
 
 		 717 aa  1368    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  97.63 
 
 		 728 aa  1429    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  83.73 
 
 		 784 aa  1253    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  82.93 
 
 		 399 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  55.86 
 
 		 710 aa  809    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  62.48 
 
 		 749 aa  892    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  54.01 
 
 		 716 aa  782    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 717 aa  1471    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  60.08 
 
 		 730 aa  872    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  59.81 
 
 		 730 aa  871    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  44.79 
 
 		 735 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  44.51 
 
 		 726 aa  555  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  43.02 
 
 		 724 aa  549  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  34.2 
 
 		 708 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 		 708 aa  346  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  33.15 
 
 		 742 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  33.01 
 
 		 728 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 		 723 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 		 703 aa  334  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 689 aa  330  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 739 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 718 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 720 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  32.63 
 
 		 776 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 		 738 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  32.41 
 
 		 758 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 770 aa  317  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 705 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 746 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 705 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 		 747 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 		 747 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 		 747 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 		 755 aa  312  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 707 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 707 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 704 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 		 701 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 712 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 696 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  31.42 
 
 		 822 aa  301  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 721 aa  301  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  31.26 
 
 		 696 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  31.26 
 
 		 696 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 727 aa  300  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 703 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  30.9 
 
 		 756 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.61 
 
 		 820 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 756 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 756 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.47 
 
 		 756 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 756 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 756 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 690 aa  283  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 779 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  29.48 
 
 		 797 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  29.05 
 
 		 737 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 721 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 720 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  27.74 
 
 		 813 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 770 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 710 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 710 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 707 aa  169  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.02 
 
 		 601 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 780 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 763 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 760 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 709 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 757 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  25.12 
 
 		 527 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 		 773 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 731 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 731 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 766 aa  144  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 731 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 717 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 730 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 768 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 730 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  23.51 
 
 		 719 aa  138  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  25.93 
 
 		 753 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 		 730 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 769 aa  137  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 		 730 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 738 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 797 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 784 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 797 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  24.38 
 
 		 730 aa  134  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  23.16 
 
 		 696 aa  133  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 797 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 		 792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 700 aa  132  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 705 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 742 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 706 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 706 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 710 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 698 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>