More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1407 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  76.74 
 
 		 721 aa  1056    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  61.13 
 
 		 747 aa  818    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  61.54 
 
 		 747 aa  829    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  60.76 
 
 		 727 aa  844    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  53.61 
 
 		 755 aa  709    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  61.24 
 
 		 747 aa  824    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  55.46 
 
 		 776 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  60.09 
 
 		 738 aa  811    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 705 aa  1411    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  54.59 
 
 		 758 aa  711    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  60.95 
 
 		 770 aa  818    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  47.99 
 
 		 690 aa  625  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  47.89 
 
 		 704 aa  615  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  46.25 
 
 		 707 aa  618  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  45.97 
 
 		 707 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  46.3 
 
 		 705 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  47.22 
 
 		 689 aa  596  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  42.98 
 
 		 720 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  43.1 
 
 		 718 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  46.98 
 
 		 756 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  47.13 
 
 		 820 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  46.98 
 
 		 756 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  46.98 
 
 		 756 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  47.13 
 
 		 756 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  46.98 
 
 		 756 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  46.98 
 
 		 756 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  45.47 
 
 		 696 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  45.35 
 
 		 696 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  45.35 
 
 		 696 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  44.89 
 
 		 701 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  41.85 
 
 		 708 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  45.92 
 
 		 822 aa  538  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  44.14 
 
 		 712 aa  532  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  42.34 
 
 		 708 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  42.62 
 
 		 742 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  43.58 
 
 		 746 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  42.47 
 
 		 728 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  41.26 
 
 		 739 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  42.14 
 
 		 723 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  42.05 
 
 		 703 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  38.15 
 
 		 703 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  37.2 
 
 		 720 aa  426  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 724 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 		 710 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 		 717 aa  334  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 716 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  33.74 
 
 		 730 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 726 aa  328  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  33.47 
 
 		 730 aa  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 749 aa  318  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 717 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 735 aa  312  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 728 aa  311  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  31.52 
 
 		 784 aa  300  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 721 aa  293  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  32.35 
 
 		 737 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  31.57 
 
 		 779 aa  273  8.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  30.83 
 
 		 813 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  29.94 
 
 		 797 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 719 aa  178  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 770 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 710 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 710 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 701 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 701 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 701 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 701 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 701 aa  165  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 701 aa  165  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  30.63 
 
 		 527 aa  163  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 711 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 743 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 727 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 829 aa  157  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  27.56 
 
 		 703 aa  156  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.48 
 
 		 601 aa  156  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 755 aa  156  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 744 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 726 aa  153  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 744 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 726 aa  151  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 726 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 792 aa  150  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 850 aa  150  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.51 
 
 		 833 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 757 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 722 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 860 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 789 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 815 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 864 aa  144  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  26.86 
 
 		 689 aa  143  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 837 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 723 aa  143  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 817 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 709 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  25.23 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 712 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 710 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>