More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2631 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  55.17 
 
 		 738 aa  809    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  60.95 
 
 		 705 aa  818    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  91.83 
 
 		 747 aa  1360    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  48.03 
 
 		 758 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  91.43 
 
 		 747 aa  1360    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  69.69 
 
 		 727 aa  1055    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  51.27 
 
 		 755 aa  678    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  96.92 
 
 		 747 aa  1428    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 770 aa  1548    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  48.66 
 
 		 776 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  55.59 
 
 		 721 aa  739    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  48.22 
 
 		 704 aa  584  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  46.09 
 
 		 707 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  44.54 
 
 		 707 aa  582  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  45.99 
 
 		 705 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  45.78 
 
 		 689 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  43.55 
 
 		 690 aa  558  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  44.88 
 
 		 696 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  43.24 
 
 		 708 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  43.47 
 
 		 701 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  43.62 
 
 		 696 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  43.62 
 
 		 696 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  43.76 
 
 		 712 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  43.84 
 
 		 720 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  43.86 
 
 		 718 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  43.52 
 
 		 756 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  43.37 
 
 		 756 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  41.65 
 
 		 739 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  43.37 
 
 		 756 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  43.37 
 
 		 820 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  43.37 
 
 		 756 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  43.37 
 
 		 756 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  43.37 
 
 		 756 aa  505  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  40.86 
 
 		 822 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  42.21 
 
 		 746 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  41.91 
 
 		 708 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  40.18 
 
 		 723 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 728 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 742 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  40.34 
 
 		 703 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  39.2 
 
 		 703 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  35.85 
 
 		 720 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  34.11 
 
 		 717 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  34.5 
 
 		 749 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  34.21 
 
 		 730 aa  323  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  34.89 
 
 		 726 aa  320  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  33.93 
 
 		 730 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 		 728 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 710 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 717 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 724 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  32.7 
 
 		 784 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 735 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 716 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 721 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  31.81 
 
 		 797 aa  270  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  30.4 
 
 		 779 aa  253  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  30.82 
 
 		 737 aa  251  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  29.99 
 
 		 813 aa  248  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 399 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.27 
 
 		 601 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  30.98 
 
 		 527 aa  162  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 719 aa  156  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 860 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 769 aa  154  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 715 aa  152  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 745 aa  151  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 770 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 710 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 850 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 711 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 718 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 726 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 710 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 710 aa  145  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  27.79 
 
 		 703 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 757 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 713 aa  141  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 708 aa  140  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  25.95 
 
 		 695 aa  140  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 709 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 817 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 706 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 711 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 706 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 837 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 727 aa  139  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 776 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 738 aa  138  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 789 aa  138  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 742 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  23.61 
 
 		 693 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 701 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 742 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 712 aa  135  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  24.23 
 
 		 693 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 701 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 744 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 762 aa  134  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 744 aa  134  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>