More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2391 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  100 
 
 
762 aa  1561    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 
815 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 
862 aa  227  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 
726 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 
743 aa  219  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 
850 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 
859 aa  218  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 
864 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 
860 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 
726 aa  213  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 
726 aa  213  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 
837 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 
706 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 
706 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 
719 aa  210  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 
843 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  29.36 
 
 
695 aa  207  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 
795 aa  208  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 
817 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 
707 aa  203  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 
792 aa  201  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 
770 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 
769 aa  197  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 
710 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 
710 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  30.67 
 
 
713 aa  193  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  30.67 
 
 
713 aa  193  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 
713 aa  191  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 
825 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 
812 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 
776 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  28.34 
 
 
753 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 
825 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 
701 aa  188  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 
710 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 
734 aa  184  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 
726 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.64 
 
 
703 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 
703 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 
726 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 
701 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 
757 aa  175  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  25.64 
 
 
690 aa  173  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 
706 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 
789 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 
706 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 
706 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 
722 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 
721 aa  171  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 
714 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 
736 aa  171  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 
771 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 
741 aa  170  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 
733 aa  170  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 
697 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 
689 aa  169  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 
713 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 
744 aa  168  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 
757 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 
709 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 
714 aa  167  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 
715 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 
730 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 
799 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 
732 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 
712 aa  167  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 
809 aa  167  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 
703 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 
771 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 
708 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 
744 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.53 
 
 
724 aa  166  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 
727 aa  165  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 
722 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 
707 aa  164  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 
696 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 
702 aa  164  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 
776 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.66 
 
 
696 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 
708 aa  163  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 
810 aa  163  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 
829 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  28.09 
 
 
689 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 
766 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 
708 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 
796 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 
806 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.6 
 
 
708 aa  161  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.65 
 
 
703 aa  161  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 
694 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 
796 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 
718 aa  160  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 
755 aa  160  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 
753 aa  160  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 
769 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 
703 aa  160  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 
732 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 
815 aa  159  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 
796 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 
707 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>