More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1526 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  66.94 
 
 		 726 aa  978    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 724 aa  1474    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  64.16 
 
 		 735 aa  947    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  47 
 
 		 730 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  46.72 
 
 		 730 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  43.76 
 
 		 749 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  43.24 
 
 		 716 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  43.67 
 
 		 717 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  42.84 
 
 		 717 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  42.42 
 
 		 728 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  42.78 
 
 		 784 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  41.83 
 
 		 710 aa  544  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  37.62 
 
 		 703 aa  363  6e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  35.79 
 
 		 704 aa  360  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  35.46 
 
 		 755 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  35.43 
 
 		 689 aa  343  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  34.02 
 
 		 705 aa  340  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 		 707 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  34.24 
 
 		 707 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 		 738 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 		 776 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 705 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 758 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 721 aa  317  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 690 aa  316  8e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 		 708 aa  311  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 770 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 747 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 739 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 696 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 		 747 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 747 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 		 701 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 696 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 696 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 742 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 		 728 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 727 aa  296  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 		 708 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 723 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 		 746 aa  291  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  32.4 
 
 		 737 aa  290  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 712 aa  288  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  31.4 
 
 		 822 aa  283  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 756 aa  280  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  31.5 
 
 		 756 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 		 756 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 		 756 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  31.36 
 
 		 756 aa  277  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  31.5 
 
 		 820 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 756 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 718 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 720 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 703 aa  266  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 721 aa  261  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 779 aa  254  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  29.87 
 
 		 797 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  37.73 
 
 		 399 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  29.97 
 
 		 813 aa  243  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 720 aa  239  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.57 
 
 		 601 aa  164  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 719 aa  158  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 710 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  27.98 
 
 		 527 aa  154  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 710 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 770 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 727 aa  140  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 		 792 aa  138  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 700 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  25.57 
 
 		 711 aa  135  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  25.8 
 
 		 716 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 713 aa  134  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 		 730 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 850 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 757 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 709 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 734 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 712 aa  130  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 710 aa  127  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 817 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  25.99 
 
 		 680 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  24.05 
 
 		 695 aa  125  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 706 aa  124  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 794 aa  124  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 706 aa  124  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 860 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  25.43 
 
 		 768 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  23.51 
 
 		 769 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  23.93 
 
 		 715 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  23 
 
 		 689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 707 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 715 aa  121  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  23.49 
 
 		 737 aa  120  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 780 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  25.58 
 
 		 728 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  25.27 
 
 		 729 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  25.27 
 
 		 729 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 762 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  25.27 
 
 		 729 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  25.27 
 
 		 729 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>