More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3002 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  92.05 
 
 		 728 aa  1364    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  83.45 
 
 		 784 aa  1254    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  60.08 
 
 		 730 aa  867    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  91.77 
 
 		 717 aa  1356    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  83.2 
 
 		 399 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  56.83 
 
 		 710 aa  805    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  54.63 
 
 		 716 aa  789    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  63.05 
 
 		 749 aa  886    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  60.36 
 
 		 730 aa  866    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 717 aa  1470    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  44.17 
 
 		 735 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  44.7 
 
 		 726 aa  562  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  43.87 
 
 		 724 aa  556  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  35.86 
 
 		 708 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  34.84 
 
 		 708 aa  353  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  34.66 
 
 		 728 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 739 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  34.52 
 
 		 742 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  35.27 
 
 		 723 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 		 703 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 		 776 aa  337  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 		 689 aa  335  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 		 705 aa  334  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 720 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 718 aa  333  9e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 		 758 aa  331  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  33.95 
 
 		 770 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 747 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 		 747 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 747 aa  328  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 		 738 aa  325  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  34.61 
 
 		 746 aa  325  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 755 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 701 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  33.2 
 
 		 727 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  31.97 
 
 		 704 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 707 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 712 aa  315  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 705 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 707 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 696 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  32.01 
 
 		 822 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 696 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 696 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 721 aa  312  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 703 aa  308  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  30.92 
 
 		 756 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.64 
 
 		 820 aa  300  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 756 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 756 aa  296  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 690 aa  295  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 756 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  30.5 
 
 		 756 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 756 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 779 aa  274  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  29.92 
 
 		 797 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 721 aa  243  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 720 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  28.42 
 
 		 737 aa  234  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  28.09 
 
 		 813 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 707 aa  181  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  25.2 
 
 		 710 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 770 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 710 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 709 aa  167  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 757 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 773 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 760 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 780 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 719 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 763 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 766 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.25 
 
 		 601 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  25.78 
 
 		 527 aa  151  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  25.2 
 
 		 731 aa  150  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 784 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 768 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 731 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 731 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 730 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 717 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 730 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 797 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 797 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.03 
 
 		 703 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 730 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 730 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 797 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  25.84 
 
 		 730 aa  140  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  25.84 
 
 		 753 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.6 
 
 		 711 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  23.95 
 
 		 708 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 797 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 701 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 		 769 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 706 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  23.92 
 
 		 706 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 792 aa  137  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 710 aa  137  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 694 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>