More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1899 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  47.3 
 
 
707 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  99.87 
 
 
756 aa  1500    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  68.44 
 
 
701 aa  952    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  100 
 
 
756 aa  1501    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  98.81 
 
 
820 aa  1485    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  69.19 
 
 
696 aa  964    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  48.12 
 
 
705 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  92.73 
 
 
822 aa  1384    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
756 aa  1501    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  68.15 
 
 
696 aa  940    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  99.07 
 
 
756 aa  1487    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  98.54 
 
 
756 aa  1483    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
756 aa  1501    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  68.15 
 
 
696 aa  940    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  47.44 
 
 
707 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  44.43 
 
 
758 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  44.28 
 
 
776 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  44.76 
 
 
689 aa  575  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  45.47 
 
 
755 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  44.93 
 
 
704 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  43.07 
 
 
708 aa  559  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  46.98 
 
 
705 aa  552  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  42.31 
 
 
718 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  43.31 
 
 
720 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  41.37 
 
 
739 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  43.22 
 
 
746 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  42.39 
 
 
708 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  42.53 
 
 
742 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  42.06 
 
 
728 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  46.63 
 
 
721 aa  524  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  40.8 
 
 
723 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  42.32 
 
 
738 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  43.37 
 
 
747 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  43.37 
 
 
770 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  42.71 
 
 
747 aa  505  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 
747 aa  505  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  42.5 
 
 
727 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  41.56 
 
 
712 aa  481  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  40.86 
 
 
690 aa  482  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  42.49 
 
 
703 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  38.82 
 
 
720 aa  465  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 
703 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 
716 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 
749 aa  300  8e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 
717 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 
710 aa  293  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  30.86 
 
 
730 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  30.73 
 
 
730 aa  287  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 
728 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 
717 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  30.42 
 
 
784 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 
724 aa  277  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 
726 aa  251  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 
721 aa  246  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 
779 aa  244  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 
735 aa  242  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  30.87 
 
 
737 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  29.3 
 
 
797 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  28.01 
 
 
813 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 
399 aa  177  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 
797 aa  172  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.99 
 
 
718 aa  163  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 
723 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 
719 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 
527 aa  154  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 
778 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 
757 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.09 
 
 
601 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 
829 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  24.97 
 
 
752 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 
709 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 
799 aa  148  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.48 
 
 
833 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 
733 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 
701 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 
712 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 
730 aa  144  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 
831 aa  144  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 
749 aa  144  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 
701 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 
701 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 
699 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 
850 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 
863 aa  142  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 
715 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 
707 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  24.58 
 
 
779 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  24.32 
 
 
747 aa  140  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  24.75 
 
 
745 aa  140  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  24.32 
 
 
747 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  26.78 
 
 
801 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  24.21 
 
 
747 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 
828 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  24.43 
 
 
828 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  24.32 
 
 
747 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 
745 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 
700 aa  138  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 
745 aa  138  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 
711 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  23.55 
 
 
689 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>