More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3657 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  48.41 
 
 		 730 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 735 aa  1483    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  66.52 
 
 		 724 aa  952    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  66.02 
 
 		 726 aa  950    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  48.27 
 
 		 730 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  43.99 
 
 		 749 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  45.85 
 
 		 716 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  44.67 
 
 		 717 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  42.72 
 
 		 710 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  43.4 
 
 		 728 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  43.56 
 
 		 717 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  43.23 
 
 		 784 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 		 755 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  32.48 
 
 		 704 aa  327  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 776 aa  326  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 		 707 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  32.47 
 
 		 707 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 705 aa  320  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 		 703 aa  319  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 		 758 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 689 aa  314  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 705 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 738 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 		 742 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 723 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  33.02 
 
 		 728 aa  303  9e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 708 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 690 aa  299  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 739 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 770 aa  298  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 747 aa  295  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 		 747 aa  291  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 747 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 721 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 708 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 746 aa  282  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 703 aa  281  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 720 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 718 aa  277  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 712 aa  276  8e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 		 727 aa  275  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  31.69 
 
 		 737 aa  273  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 696 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 779 aa  267  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 701 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 696 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 696 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  39.42 
 
 		 399 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 721 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 756 aa  247  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 720 aa  246  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  29.82 
 
 		 756 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 756 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  29.82 
 
 		 756 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 756 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 756 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  29.82 
 
 		 820 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  28.65 
 
 		 822 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  28.99 
 
 		 813 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  28.4 
 
 		 797 aa  239  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.49 
 
 		 601 aa  178  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 713 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 700 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 792 aa  154  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 730 aa  153  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 710 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 710 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 719 aa  151  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 770 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  26.36 
 
 		 680 aa  147  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 706 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 706 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  27.25 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  25.59 
 
 		 716 aa  140  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  25.8 
 
 		 695 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 712 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 749 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 757 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 		 709 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 727 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 707 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 785 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 817 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 819 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.36 
 
 		 711 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 860 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  24.75 
 
 		 753 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 734 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 767 aa  126  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  23.73 
 
 		 715 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 864 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  23.21 
 
 		 769 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 755 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 799 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 737 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 		 723 aa  125  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.75 
 
 		 801 aa  125  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 766 aa  125  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  24.11 
 
 		 731 aa  124  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 689 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>