More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2054 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 703 aa  1394    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  42.05 
 
 		 755 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  41.53 
 
 		 758 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  42.05 
 
 		 705 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  42.94 
 
 		 696 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  40.69 
 
 		 776 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  43.14 
 
 		 701 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  42.99 
 
 		 696 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  42.99 
 
 		 696 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  40.65 
 
 		 720 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  39.94 
 
 		 718 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  40.86 
 
 		 738 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  42.32 
 
 		 822 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  43.35 
 
 		 756 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  43.35 
 
 		 820 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  38.49 
 
 		 708 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  43.5 
 
 		 756 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  43.35 
 
 		 756 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  39.66 
 
 		 703 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  43.5 
 
 		 756 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  43.35 
 
 		 756 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  39.15 
 
 		 705 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  43.2 
 
 		 756 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  39.44 
 
 		 707 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  39.79 
 
 		 707 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  40.18 
 
 		 708 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  41.98 
 
 		 721 aa  465  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  39.43 
 
 		 690 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  38.56 
 
 		 723 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  40.66 
 
 		 770 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  39.39 
 
 		 727 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  39.74 
 
 		 704 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  38.08 
 
 		 728 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  40.21 
 
 		 747 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  39.54 
 
 		 746 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  39.73 
 
 		 747 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  39.65 
 
 		 689 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  39.59 
 
 		 747 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 739 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  38.08 
 
 		 742 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  39.18 
 
 		 712 aa  428  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  38.54 
 
 		 720 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 724 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 		 726 aa  340  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  34.79 
 
 		 730 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  34.65 
 
 		 730 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 		 717 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 		 749 aa  333  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 710 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  33.84 
 
 		 716 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 		 717 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 		 728 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  33.01 
 
 		 784 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 735 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 779 aa  291  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  32.48 
 
 		 737 aa  260  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 721 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  29.66 
 
 		 797 aa  237  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  29.36 
 
 		 813 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.19 
 
 		 601 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  31.49 
 
 		 527 aa  190  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 399 aa  187  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 727 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 770 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 710 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 710 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 707 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 722 aa  163  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 701 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 792 aa  161  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 719 aa  160  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 701 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 		 736 aa  158  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 701 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 755 aa  154  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 757 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 701 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 701 aa  152  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  27.37 
 
 		 728 aa  151  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 701 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.63 
 
 		 801 aa  151  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  28.4 
 
 		 689 aa  150  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 860 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 753 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 779 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 745 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 784 aa  147  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 718 aa  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  23.27 
 
 		 701 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 837 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 710 aa  144  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 769 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 812 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 831 aa  142  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.19 
 
 		 833 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 715 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 694 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 820 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 769 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 715 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>