More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3362 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  100 
 
 		 813 aa  1660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  68.9 
 
 		 797 aa  1094    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  48.4 
 
 		 737 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 705 aa  288  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 707 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 707 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 779 aa  281  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  30.55 
 
 		 755 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 704 aa  279  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 758 aa  274  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 		 705 aa  273  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 721 aa  271  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 716 aa  267  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 689 aa  266  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 690 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 776 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 738 aa  260  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 747 aa  253  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 721 aa  252  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 747 aa  251  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 747 aa  248  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 770 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 726 aa  247  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 696 aa  244  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 724 aa  243  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 		 727 aa  243  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 710 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 735 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  29.25 
 
 		 730 aa  238  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  29.25 
 
 		 730 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 739 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 708 aa  235  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 756 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 746 aa  233  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 742 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 720 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 756 aa  230  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 703 aa  230  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 728 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  28.73 
 
 		 756 aa  229  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 712 aa  229  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  28.01 
 
 		 820 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  28.31 
 
 		 822 aa  229  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 717 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 756 aa  229  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 718 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 756 aa  229  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 696 aa  228  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 696 aa  228  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 708 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  27.73 
 
 		 756 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 701 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 723 aa  221  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  27.76 
 
 		 784 aa  220  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 728 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 703 aa  219  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 717 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 749 aa  218  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 720 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 		 527 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.06 
 
 		 601 aa  152  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 710 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 710 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 770 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 748 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 748 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  23.85 
 
 		 738 aa  125  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  24.42 
 
 		 740 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  25.06 
 
 		 742 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 749 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 707 aa  119  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 		 742 aa  118  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  23.81 
 
 		 680 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 714 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.54 
 
 		 724 aa  115  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 744 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 792 aa  114  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 743 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 744 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 712 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 766 aa  112  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.45 
 
 		 709 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 737 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 706 aa  111  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 706 aa  111  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  21.31 
 
 		 689 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  23.59 
 
 		 753 aa  110  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 732 aa  110  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  21.08 
 
 		 689 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  24.21 
 
 		 695 aa  109  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 		 715 aa  108  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 711 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 726 aa  107  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  24.43 
 
 		 707 aa  106  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  23.87 
 
 		 735 aa  106  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 		 696 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  21.46 
 
 		 700 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 708 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 778 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 718 aa  105  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>