More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4624 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  99 
 
 		 797 aa  1611    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  92.6 
 
 		 797 aa  1524    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  59.25 
 
 		 715 aa  802    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3417  TonB dependent outer membrane ferrichrome-iron receptor  58.96 
 
 		 715 aa  798    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3330  hypothetical protein  58.06 
 
 		 714 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.641382  normal  0.572781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  60.66 
 
 		 708 aa  850    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 797 aa  1627    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  44.73 
 
 		 699 aa  554  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  37.16 
 
 		 718 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  32.72 
 
 		 778 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.59 
 
 		 797 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.58 
 
 		 806 aa  333  9e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 		 829 aa  326  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 		 802 aa  317  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 828 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 		 799 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.62 
 
 		 833 aa  313  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 828 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 		 817 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 829 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 808 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 810 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 828 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 		 810 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 797 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 		 791 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 797 aa  301  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 810 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  29.64 
 
 		 791 aa  299  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 810 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 794 aa  296  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 821 aa  296  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 820 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 		 812 aa  295  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  29.71 
 
 		 799 aa  290  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 806 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 779 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  28.62 
 
 		 799 aa  284  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  30.71 
 
 		 801 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 815 aa  282  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  29.88 
 
 		 808 aa  281  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 735 aa  280  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 753 aa  280  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 733 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 717 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  32.01 
 
 		 718 aa  278  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  29.93 
 
 		 729 aa  275  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  30.12 
 
 		 729 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  29.8 
 
 		 729 aa  273  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  29.97 
 
 		 703 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  29.72 
 
 		 747 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  29.97 
 
 		 703 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  30.28 
 
 		 747 aa  270  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  30.14 
 
 		 747 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 771 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  32.32 
 
 		 719 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 769 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 696 aa  269  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 		 831 aa  268  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 819 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  30.14 
 
 		 747 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 828 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  29.44 
 
 		 747 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  32 
 
 		 740 aa  266  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 723 aa  266  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 771 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 740 aa  266  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  30.23 
 
 		 745 aa  266  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 		 757 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  30.15 
 
 		 729 aa  261  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 724 aa  261  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  28.29 
 
 		 696 aa  260  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  28.29 
 
 		 698 aa  260  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 863 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 		 784 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  28.14 
 
 		 696 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 714 aa  258  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 789 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  28.29 
 
 		 696 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  28.14 
 
 		 696 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 785 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  29.58 
 
 		 729 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 701 aa  254  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 747 aa  254  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  30 
 
 		 747 aa  254  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 877 aa  253  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 785 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 794 aa  253  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 699 aa  253  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  28.59 
 
 		 747 aa  252  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 784 aa  252  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 822 aa  252  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.11 
 
 		 689 aa  251  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 750 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 736 aa  249  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  28.85 
 
 		 752 aa  249  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 705 aa  248  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 745 aa  248  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 745 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 750 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>