More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1503 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1503  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 643 aa  1335    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  38.99 
 
 		 713 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  39.53 
 
 		 711 aa  438  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  36.46 
 
 		 716 aa  416  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  36.21 
 
 		 715 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2356  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 700 aa  362  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.084285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 		 715 aa  350  6e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  32.67 
 
 		 729 aa  311  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  31.94 
 
 		 745 aa  310  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  32.04 
 
 		 747 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  31.89 
 
 		 747 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  31.89 
 
 		 747 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  32.04 
 
 		 747 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  31.56 
 
 		 729 aa  302  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  32.04 
 
 		 747 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.84 
 
 		 833 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  30.55 
 
 		 748 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 747 aa  297  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  31.45 
 
 		 747 aa  297  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  31.43 
 
 		 747 aa  296  7e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  30.75 
 
 		 752 aa  293  9e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  29.65 
 
 		 729 aa  291  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 721 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  29.65 
 
 		 729 aa  290  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  30.34 
 
 		 729 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  30.34 
 
 		 703 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  30.34 
 
 		 703 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 717 aa  289  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 740 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 789 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 		 806 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 723 aa  277  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 733 aa  276  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  32.66 
 
 		 714 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 735 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 829 aa  273  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 		 710 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 705 aa  272  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  29.97 
 
 		 728 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 726 aa  270  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 		 817 aa  269  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 		 799 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 831 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  30.69 
 
 		 779 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  30.15 
 
 		 740 aa  262  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 701 aa  261  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 745 aa  260  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  30.02 
 
 		 733 aa  260  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 815 aa  259  8e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  30.82 
 
 		 799 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 829 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.41 
 
 		 797 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.23 
 
 		 806 aa  257  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  29.98 
 
 		 699 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 828 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 		 701 aa  254  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 		 728 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 794 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 799 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 		 785 aa  252  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 797 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 		 785 aa  252  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 		 665 aa  251  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 736 aa  251  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 784 aa  251  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 728 aa  250  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 776 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 729 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 754 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 810 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 828 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 		 828 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  30.97 
 
 		 801 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  29.2 
 
 		 696 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 754 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 820 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 754 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  29.47 
 
 		 808 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  29.2 
 
 		 696 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4066  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 785 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 719 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  29.2 
 
 		 696 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 696 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 808 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 828 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 821 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 750 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  29.05 
 
 		 696 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 819 aa  243  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  30.3 
 
 		 753 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 705 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  29.76 
 
 		 740 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 683 aa  242  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  30.3 
 
 		 753 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 737 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  28.66 
 
 		 750 aa  242  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  29.05 
 
 		 698 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6070  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 729 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 738 aa  241  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 		 741 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>