More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3640 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  60.36 
 
 
797 aa  846    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  60.66 
 
 
797 aa  850    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
708 aa  1449    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  55.33 
 
 
715 aa  776    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3417  TonB dependent outer membrane ferrichrome-iron receptor  55.05 
 
 
715 aa  774    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3330  hypothetical protein  54.24 
 
 
714 aa  781    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.641382  normal  0.572781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  60.36 
 
 
797 aa  850    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  41.71 
 
 
699 aa  545  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.46 
 
 
718 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 
817 aa  296  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 
799 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 
736 aa  294  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  31.06 
 
 
729 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  30.44 
 
 
733 aa  287  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 
820 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  31.88 
 
 
719 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  30.58 
 
 
799 aa  285  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.77 
 
 
806 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 
829 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 
778 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  30.45 
 
 
740 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.78 
 
 
797 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 
828 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 
794 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  32.74 
 
 
799 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 
808 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 
771 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 
828 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 
723 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 
771 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 
797 aa  270  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  31.01 
 
 
729 aa  270  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 
828 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 
821 aa  269  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 
699 aa  269  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 
717 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 
779 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 
810 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 
829 aa  267  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 
769 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  28.89 
 
 
729 aa  266  8e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  29.26 
 
 
729 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  28.51 
 
 
703 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  28.51 
 
 
729 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  28.51 
 
 
703 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 
735 aa  265  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 
797 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 
696 aa  265  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 
740 aa  264  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 
727 aa  265  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 
705 aa  263  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 
819 aa  262  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 
791 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  28.98 
 
 
698 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  28.61 
 
 
719 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  29.28 
 
 
747 aa  260  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  30.33 
 
 
808 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 
810 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  28.7 
 
 
791 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 
714 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  28.98 
 
 
696 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 
789 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  28.83 
 
 
696 aa  258  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 
812 aa  258  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  28.83 
 
 
696 aa  258  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 
810 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 
810 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  28.99 
 
 
747 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  28.68 
 
 
696 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  28.89 
 
 
724 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 
724 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 
802 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  29.35 
 
 
718 aa  254  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 
701 aa  253  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  29.53 
 
 
801 aa  253  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  28.38 
 
 
728 aa  253  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 
794 aa  253  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.23 
 
 
833 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 
806 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  27.32 
 
 
747 aa  250  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 
815 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 
745 aa  249  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 
733 aa  248  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  28.28 
 
 
747 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 
705 aa  247  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  29.31 
 
 
701 aa  246  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  28.13 
 
 
747 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  28.13 
 
 
747 aa  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 
784 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  27.19 
 
 
726 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 
753 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  28.07 
 
 
745 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 
822 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  29.16 
 
 
706 aa  240  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 
696 aa  240  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  28.22 
 
 
752 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 
719 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  27.01 
 
 
740 aa  238  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 
863 aa  236  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 
754 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>