More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1099 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 643 aa  1315    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  38.48 
 
 		 714 aa  287  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  35.39 
 
 		 653 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  34.97 
 
 		 670 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 687 aa  259  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 679 aa  250  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  31.5 
 
 		 704 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  31.5 
 
 		 704 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  33.51 
 
 		 705 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  32.53 
 
 		 702 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  34.76 
 
 		 684 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 678 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 715 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  30.59 
 
 		 737 aa  196  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  44.21 
 
 		 707 aa  193  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 668 aa  191  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  41.7 
 
 		 715 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  29.42 
 
 		 676 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  27.17 
 
 		 680 aa  140  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  29.19 
 
 		 642 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  24.26 
 
 		 678 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  29.05 
 
 		 662 aa  131  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 715 aa  124  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  26.87 
 
 		 615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  33.62 
 
 		 718 aa  122  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 710 aa  118  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  33.6 
 
 		 617 aa  114  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 626 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 626 aa  108  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 681 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.41 
 
 		 655 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  26.46 
 
 		 641 aa  104  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 710 aa  103  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 705 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  27.3 
 
 		 687 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 645 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  32.51 
 
 		 667 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 699 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 671 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 615 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  23.48 
 
 		 652 aa  98.2  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  37.29 
 
 		 637 aa  97.8  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25.29 
 
 		 653 aa  96.3  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  24.39 
 
 		 680 aa  96.3  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  24.17 
 
 		 636 aa  94.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 762 aa  94.7  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  33.85 
 
 		 627 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  25 
 
 		 652 aa  92.8  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.74 
 
 		 656 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  22.67 
 
 		 732 aa  91.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  38.78 
 
 		 668 aa  90.5  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  42.31 
 
 		 1128 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 612 aa  90.1  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  33.71 
 
 		 665 aa  89  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 737 aa  89  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 670 aa  88.2  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  31.33 
 
 		 614 aa  88.2  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  37.99 
 
 		 593 aa  88.2  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 634 aa  87.4  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 665 aa  87  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 652 aa  87.4  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 602 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 625 aa  87  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 658 aa  87  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 709 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.69 
 
 		 646 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  22.88 
 
 		 673 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 662 aa  85.5  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 670 aa  84.7  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  22.88 
 
 		 659 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 624 aa  84.7  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 648 aa  84.3  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 696 aa  84  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 628 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 838 aa  84.3  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  24.62 
 
 		 613 aa  83.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.58 
 
 		 639 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  28.96 
 
 		 671 aa  83.6  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 649 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 679 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.17 
 
 		 663 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 641 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1347  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 820 aa  82.4  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  27.94 
 
 		 815 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  23.17 
 
 		 663 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  35.43 
 
 		 849 aa  83.2  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  30.21 
 
 		 714 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  24.19 
 
 		 641 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.17 
 
 		 663 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  37.95 
 
 		 616 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 694 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.17 
 
 		 663 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 645 aa  82.4  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 864 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  25.45 
 
 		 700 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  22.97 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  22.97 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  25.89 
 
 		 739 aa  81.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 806 aa  81.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 742 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>