More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5030 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 680 aa  1389    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  50.24 
 
 		 652 aa  632  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  48.19 
 
 		 699 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  48.19 
 
 		 671 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  37.67 
 
 		 681 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  38.84 
 
 		 673 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  36.26 
 
 		 645 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  35.5 
 
 		 696 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  36.65 
 
 		 671 aa  360  6e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 702 aa  351  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 675 aa  319  9e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 662 aa  308  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 705 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.97 
 
 		 686 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 634 aa  127  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  25.43 
 
 		 662 aa  120  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 653 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 628 aa  118  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  25.65 
 
 		 641 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 662 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 662 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 649 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 649 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 627 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 662 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 680 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 661 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.98 
 
 		 646 aa  110  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 641 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  25.04 
 
 		 661 aa  109  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  26.24 
 
 		 623 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.74 
 
 		 666 aa  106  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.19 
 
 		 666 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.19 
 
 		 666 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 613 aa  105  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.19 
 
 		 666 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.17 
 
 		 666 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  27.3 
 
 		 671 aa  104  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  26.74 
 
 		 628 aa  104  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 715 aa  104  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  34.36 
 
 		 718 aa  103  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 757 aa  103  9e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 634 aa  103  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.17 
 
 		 653 aa  103  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.6 
 
 		 633 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 709 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0993  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 826 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  25.26 
 
 		 671 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  35.8 
 
 		 680 aa  99.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  24.87 
 
 		 678 aa  100  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.34 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  23.93 
 
 		 638 aa  99.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  25.31 
 
 		 732 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  23.78 
 
 		 704 aa  98.6  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.05 
 
 		 663 aa  98.6  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 714 aa  97.8  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.38 
 
 		 615 aa  97.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 642 aa  97.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  23.77 
 
 		 615 aa  97.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  25.44 
 
 		 698 aa  97.1  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  25.58 
 
 		 696 aa  95.9  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.89 
 
 		 623 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 634 aa  95.5  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.2 
 
 		 653 aa  95.1  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 698 aa  95.1  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.97 
 
 		 615 aa  95.1  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 747 aa  94.4  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.44 
 
 		 631 aa  93.6  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 710 aa  93.6  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  25.48 
 
 		 739 aa  93.2  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 687 aa  93.2  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 673 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 762 aa  92.8  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  25.25 
 
 		 696 aa  92.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  24.09 
 
 		 668 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  23.21 
 
 		 686 aa  92.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 710 aa  91.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.32 
 
 		 630 aa  91.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  33.03 
 
 		 670 aa  91.3  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 593 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.9 
 
 		 688 aa  89.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  33.95 
 
 		 676 aa  89  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  24.01 
 
 		 665 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 678 aa  89.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  23.97 
 
 		 680 aa  88.6  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  24.95 
 
 		 593 aa  88.6  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  24.72 
 
 		 746 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  23.92 
 
 		 698 aa  88.2  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 649 aa  88.2  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  23.85 
 
 		 665 aa  87.8  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  23.85 
 
 		 665 aa  87.8  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 615 aa  87.4  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  31.95 
 
 		 642 aa  86.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  27.13 
 
 		 639 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.34 
 
 		 696 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.47 
 
 		 695 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 627 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  22.45 
 
 		 668 aa  85.1  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 692 aa  84.7  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>