More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2952 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 645 aa  1321    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  58.93 
 
 		 671 aa  739    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  37.13 
 
 		 652 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  36.9 
 
 		 671 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  36.9 
 
 		 699 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  36.26 
 
 		 680 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  31.51 
 
 		 673 aa  295  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 681 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 696 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 675 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 662 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 702 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 710 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 705 aa  95.1  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  22.92 
 
 		 641 aa  93.2  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  22.75 
 
 		 633 aa  91.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.08 
 
 		 666 aa  90.9  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  25.5 
 
 		 666 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  25.5 
 
 		 666 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.08 
 
 		 663 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.08 
 
 		 663 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  21.67 
 
 		 647 aa  88.2  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.08 
 
 		 663 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 715 aa  88.6  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 663 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.08 
 
 		 663 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.08 
 
 		 663 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  25.06 
 
 		 666 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  25.52 
 
 		 663 aa  87.8  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.08 
 
 		 659 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.28 
 
 		 641 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 676 aa  87  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 681 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  25.22 
 
 		 663 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  25.28 
 
 		 666 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 698 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  25.17 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 751 aa  84  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 634 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 687 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  25.05 
 
 		 655 aa  82  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 643 aa  82.4  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 658 aa  81.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  29.94 
 
 		 678 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  24.86 
 
 		 618 aa  81.3  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 679 aa  80.9  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  32.6 
 
 		 680 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 709 aa  80.5  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  24.06 
 
 		 698 aa  80.5  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0510  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.85 
 
 		 680 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.382474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  24.82 
 
 		 665 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  24.82 
 
 		 665 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  24.22 
 
 		 794 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.41 
 
 		 653 aa  77.8  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1552  TonB-dependent receptor, plug  21.63 
 
 		 731 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 677 aa  77.4  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  24.59 
 
 		 665 aa  77.4  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.47 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 714 aa  77.4  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0993  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 826 aa  77.4  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 714 aa  77  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.23 
 
 		 661 aa  77  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  23.4 
 
 		 676 aa  77  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  23.94 
 
 		 665 aa  75.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 714 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 710 aa  75.5  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  22.62 
 
 		 652 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  22.88 
 
 		 656 aa  75.5  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  24.03 
 
 		 638 aa  75.1  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  29.03 
 
 		 668 aa  75.1  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 740 aa  74.7  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 		 726 aa  73.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  21.58 
 
 		 613 aa  73.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  23.81 
 
 		 732 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  30.14 
 
 		 670 aa  72  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 713 aa  72  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  21.67 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 641 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 678 aa  71.2  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 697 aa  71.2  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  23.35 
 
 		 704 aa  71.6  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 874 aa  71.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 688 aa  71.2  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 892 aa  70.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  21.7 
 
 		 792 aa  70.5  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  21.43 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  31.08 
 
 		 662 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  23.93 
 
 		 797 aa  69.7  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 882 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 882 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 628 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 649 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 669 aa  68.2  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 679 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  21.8 
 
 		 860 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 699 aa  67.8  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  25.73 
 
 		 718 aa  67.4  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 721 aa  67.4  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  21.79 
 
 		 859 aa  67.4  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>