108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1552 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1552  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 731 aa  1508    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0795  thiamine monophosphate synthase  24.81 
 
 		 793 aa  140  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 645 aa  78.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  23.94 
 
 		 652 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 681 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  25.41 
 
 		 615 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 705 aa  64.3  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 715 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 679 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  20.41 
 
 		 680 aa  57.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  25.82 
 
 		 678 aa  57.4  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 641 aa  57.4  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.87 
 
 		 667 aa  57.4  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 671 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 699 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.69 
 
 		 686 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  22.42 
 
 		 668 aa  55.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  33.09 
 
 		 750 aa  55.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 670 aa  54.7  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  24.79 
 
 		 642 aa  54.3  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 680 aa  54.3  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 676 aa  54.3  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 679 aa  53.5  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  25.19 
 
 		 718 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  25.71 
 
 		 641 aa  52.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  27.34 
 
 		 663 aa  52  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 663 aa  52  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 675 aa  52  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  27.34 
 
 		 663 aa  52  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  27.34 
 
 		 663 aa  52  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  27.34 
 
 		 663 aa  52  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  27.34 
 
 		 641 aa  52  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 706 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  27.34 
 
 		 659 aa  52  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 706 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  27.34 
 
 		 663 aa  52  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 694 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  23.32 
 
 		 662 aa  51.6  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.29 
 
 		 695 aa  51.6  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 702 aa  51.6  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 634 aa  50.8  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  22.67 
 
 		 673 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 710 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  26.73 
 
 		 653 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 696 aa  50.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 676 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  28.68 
 
 		 656 aa  49.7  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  27.91 
 
 		 650 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  27.91 
 
 		 650 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  27.91 
 
 		 650 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  27.91 
 
 		 650 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  27.91 
 
 		 650 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 678 aa  50.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  26.03 
 
 		 670 aa  48.9  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2576  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 783 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138902 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.39 
 
 		 647 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  30.3 
 
 		 676 aa  48.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 697 aa  48.5  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 746 aa  47.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 707 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  28.97 
 
 		 639 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 648 aa  47.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  26.39 
 
 		 704 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.91 
 
 		 759 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 710 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0510  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.87 
 
 		 680 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.382474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  29.13 
 
 		 661 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  32.59 
 
 		 668 aa  46.6  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 801 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 873 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 715 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 715 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.43 
 
 		 862 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 873 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.52 
 
 		 713 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 657 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 701 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 714 aa  45.8  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 744 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 649 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.78 
 
 		 862 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.78 
 
 		 862 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 684 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 643 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 701 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  26.8 
 
 		 671 aa  45.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 671 aa  45.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 729 aa  45.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 662 aa  45.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 729 aa  45.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1007 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 733 aa  44.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 726 aa  44.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  40.74 
 
 		 1028 aa  44.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 640 aa  44.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1007 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0993  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 826 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 883 aa  44.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2356  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 700 aa  44.7  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.084285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 869 aa  44.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>