More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2751 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  100 
 
 		 641 aa  1319    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 705 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 681 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 743 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  25.07 
 
 		 665 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  25.07 
 
 		 665 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  24.93 
 
 		 665 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 710 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 702 aa  126  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  26.42 
 
 		 640 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 696 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 634 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  24.62 
 
 		 673 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.86 
 
 		 695 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.61 
 
 		 614 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.19 
 
 		 656 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.4 
 
 		 646 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.14 
 
 		 633 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.41 
 
 		 614 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 709 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.61 
 
 		 614 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.93 
 
 		 631 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 698 aa  117  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 698 aa  117  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 698 aa  117  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  25.3 
 
 		 638 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.41 
 
 		 614 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.14 
 
 		 614 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  25.76 
 
 		 642 aa  116  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.96 
 
 		 666 aa  115  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.22 
 
 		 614 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.96 
 
 		 663 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.22 
 
 		 614 aa  114  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.22 
 
 		 614 aa  114  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.42 
 
 		 614 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 634 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.42 
 
 		 614 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 665 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.28 
 
 		 663 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 675 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.11 
 
 		 615 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 649 aa  110  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.31 
 
 		 666 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  25 
 
 		 646 aa  108  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.31 
 
 		 666 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  25.16 
 
 		 680 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.31 
 
 		 666 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.77 
 
 		 623 aa  108  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.31 
 
 		 666 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  25.09 
 
 		 678 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.78 
 
 		 615 aa  107  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 640 aa  107  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.69 
 
 		 653 aa  106  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 680 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  26.33 
 
 		 611 aa  106  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 698 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  25.74 
 
 		 676 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 687 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.54 
 
 		 686 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 611 aa  104  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 643 aa  104  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  24.61 
 
 		 662 aa  103  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  24 
 
 		 611 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 673 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  22.81 
 
 		 676 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.53 
 
 		 685 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.53 
 
 		 685 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.53 
 
 		 685 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  24.69 
 
 		 685 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  24.17 
 
 		 668 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 740 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.65 
 
 		 821 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.5 
 
 		 685 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.5 
 
 		 685 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 		 659 aa  99  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 627 aa  98.6  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  30.25 
 
 		 718 aa  98.2  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 638 aa  97.4  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0510  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.17 
 
 		 680 aa  97.8  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.382474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  37.18 
 
 		 680 aa  97.1  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.69 
 
 		 631 aa  97.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 710 aa  97.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 707 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 614 aa  95.1  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 624 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  23.51 
 
 		 706 aa  94.7  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 714 aa  94.4  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  23.64 
 
 		 617 aa  94.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 698 aa  93.6  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 684 aa  93.6  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 679 aa  93.2  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 645 aa  93.2  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  34.9 
 
 		 623 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  32.89 
 
 		 615 aa  92.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  24.06 
 
 		 671 aa  92.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 715 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 688 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 621 aa  91.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3338  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.15 
 
 		 755 aa  91.3  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.275973  decreased coverage  0.000566863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>