More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2576 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2576  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 783 aa  1570    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 681 aa  120  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 697 aa  100  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  24.24 
 
 		 704 aa  94.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  35.98 
 
 		 687 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  38.78 
 
 		 718 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  38.03 
 
 		 673 aa  85.5  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  24.13 
 
 		 698 aa  84.3  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  23.94 
 
 		 680 aa  84  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 715 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  36.57 
 
 		 665 aa  83.2  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  35.21 
 
 		 655 aa  82.4  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 649 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 678 aa  82  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  24.28 
 
 		 652 aa  81.6  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  32.03 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  32.03 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  38.3 
 
 		 686 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  32.03 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  32.03 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 661 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  32.43 
 
 		 666 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 656 aa  81.3  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  33.79 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.69 
 
 		 656 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 658 aa  80.5  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.1 
 
 		 639 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 662 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 662 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 662 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  32.17 
 
 		 665 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  32.17 
 
 		 665 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  33.1 
 
 		 663 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  32.17 
 
 		 665 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 680 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  34 
 
 		 702 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  34.67 
 
 		 705 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  23.85 
 
 		 696 aa  78.6  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  36.43 
 
 		 662 aa  79  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  35.97 
 
 		 657 aa  78.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.53 
 
 		 1023 aa  78.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  36.69 
 
 		 680 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  35.97 
 
 		 648 aa  78.2  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  33.6 
 
 		 615 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  23.16 
 
 		 702 aa  77.4  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 643 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 653 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  32 
 
 		 670 aa  76.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 706 aa  76.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 699 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  33.57 
 
 		 617 aa  76.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  29.47 
 
 		 704 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  34.19 
 
 		 732 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  36.18 
 
 		 698 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 740 aa  75.5  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  32.43 
 
 		 652 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  28.99 
 
 		 704 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  33.11 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  33.11 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  33.11 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  33.11 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1229  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 662 aa  75.5  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  33.11 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 751 aa  75.1  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 652 aa  75.1  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.43 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  32.48 
 
 		 676 aa  74.7  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 715 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.43 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.43 
 
 		 659 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.43 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.43 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 681 aa  74.7  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.43 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 676 aa  74.7  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  32.43 
 
 		 641 aa  74.3  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 687 aa  73.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  30.43 
 
 		 326 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  32.31 
 
 		 680 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 681 aa  73.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 684 aa  73.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  34.69 
 
 		 700 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 707 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 696 aa  72.8  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  32.65 
 
 		 696 aa  73.6  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 679 aa  72.8  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 624 aa  72.8  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 649 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 616 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 702 aa  71.6  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 710 aa  71.6  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 715 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  32.86 
 
 		 614 aa  71.6  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  35.25 
 
 		 653 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 702 aa  71.2  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 635 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  35.21 
 
 		 653 aa  70.5  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  30.67 
 
 		 642 aa  70.5  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>