More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_43650 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  60.99 
 
 		 704 aa  844    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  63.99 
 
 		 707 aa  917    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  61.14 
 
 		 704 aa  852    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  61.03 
 
 		 715 aa  861    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  61.81 
 
 		 715 aa  864    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  93.05 
 
 		 702 aa  1342    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  100 
 
 		 705 aa  1428    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  32.44 
 
 		 737 aa  322  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 643 aa  246  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 687 aa  198  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 684 aa  196  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 678 aa  194  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  45.89 
 
 		 670 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  38.55 
 
 		 679 aa  160  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  37.82 
 
 		 653 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  43.38 
 
 		 714 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  40.28 
 
 		 668 aa  147  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 710 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  40.61 
 
 		 642 aa  116  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  31.85 
 
 		 676 aa  110  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  33.84 
 
 		 667 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  35.59 
 
 		 615 aa  107  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  38.19 
 
 		 687 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  34.81 
 
 		 680 aa  104  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  34.83 
 
 		 678 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  39.44 
 
 		 715 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  36.3 
 
 		 718 aa  99.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 670 aa  99  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 688 aa  91.7  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  34.55 
 
 		 662 aa  91.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 611 aa  91.3  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 602 aa  90.5  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  38.69 
 
 		 616 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 615 aa  90.1  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 626 aa  89.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 649 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 626 aa  89.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 649 aa  89  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  28.76 
 
 		 906 aa  87.4  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 645 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 893 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  39.23 
 
 		 762 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  26.51 
 
 		 618 aa  84.3  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  29.48 
 
 		 617 aa  84  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  34.23 
 
 		 1023 aa  83.2  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  33.03 
 
 		 646 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 634 aa  82.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  28.91 
 
 		 611 aa  82  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.88 
 
 		 631 aa  82  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 710 aa  82  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 661 aa  82  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 746 aa  82  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 724 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 637 aa  81.6  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 662 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  29.38 
 
 		 633 aa  82  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 653 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 659 aa  81.6  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 593 aa  81.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 662 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  24.03 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 680 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.15 
 
 		 631 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.82 
 
 		 631 aa  80.5  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  27.79 
 
 		 638 aa  79.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2576  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 783 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  32.74 
 
 		 713 aa  79.7  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 786 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 1128 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  36 
 
 		 668 aa  79.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  30.72 
 
 		 668 aa  79  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 767 aa  79  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  34.18 
 
 		 639 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  35.54 
 
 		 665 aa  78.2  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 649 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  26.52 
 
 		 706 aa  78.2  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  28.86 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  33.19 
 
 		 732 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 754 aa  77.8  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  30.57 
 
 		 650 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 747 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2789  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 675 aa  76.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  21.38 
 
 		 709 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 686 aa  77  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 614 aa  76.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  27.94 
 
 		 613 aa  75.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 619 aa  76.6  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  29.55 
 
 		 737 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 		 679 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.63 
 
 		 623 aa  75.5  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.04 
 
 		 615 aa  75.1  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 695 aa  74.7  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 778 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 613 aa  75.1  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  33.91 
 
 		 631 aa  74.7  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 682 aa  74.3  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>