More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1362 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 737 aa  1518    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 707 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  33.01 
 
 		 704 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  33.19 
 
 		 704 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 715 aa  326  9e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 715 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  32.27 
 
 		 702 aa  325  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  32.44 
 
 		 705 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 668 aa  211  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 679 aa  205  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 643 aa  196  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 684 aa  170  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 687 aa  163  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 653 aa  162  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  28.04 
 
 		 670 aa  153  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 714 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0104  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 		 678 aa  103  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 710 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  33.72 
 
 		 678 aa  95.5  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  32.43 
 
 		 718 aa  90.9  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  33.8 
 
 		 667 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 715 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  31.87 
 
 		 680 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 710 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 687 aa  84  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 705 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  25.96 
 
 		 615 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  28.51 
 
 		 638 aa  82  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  29.55 
 
 		 642 aa  82  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 634 aa  81.3  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  23.71 
 
 		 633 aa  80.9  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  26.02 
 
 		 676 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 613 aa  78.2  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 681 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 659 aa  75.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.9 
 
 		 631 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 670 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 593 aa  75.5  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  22.3 
 
 		 652 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 762 aa  74.7  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.11 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.44 
 
 		 631 aa  74.3  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 699 aa  73.9  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  31.53 
 
 		 617 aa  73.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 1128 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  26.93 
 
 		 662 aa  72.4  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  23.78 
 
 		 641 aa  72  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  28.38 
 
 		 622 aa  72  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  21.95 
 
 		 688 aa  71.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 621 aa  71.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 631 aa  70.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  30.54 
 
 		 671 aa  70.5  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 615 aa  69.3  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.55 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  28.98 
 
 		 617 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  29.95 
 
 		 677 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.58 
 
 		 615 aa  68.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  23.72 
 
 		 655 aa  68.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 635 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 783 aa  68.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  33.33 
 
 		 665 aa  68.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  33.49 
 
 		 631 aa  67.8  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 747 aa  67.8  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 602 aa  67.8  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5030  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.602403  normal  0.598022 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  30.73 
 
 		 627 aa  67  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.82 
 
 		 623 aa  66.6  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  31.25 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 799 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2576  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 783 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138902 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  31.25 
 
 		 641 aa  67  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  29.58 
 
 		 650 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  31.25 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 740 aa  66.2  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.29 
 
 		 656 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 648 aa  66.6  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 657 aa  66.6  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  31.25 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  31.25 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  31.47 
 
 		 636 aa  66.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  31.25 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 688 aa  66.6  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  31.25 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.79 
 
 		 618 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  29.58 
 
 		 650 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  32.03 
 
 		 656 aa  66.6  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  29.58 
 
 		 650 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  29.58 
 
 		 650 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  29.58 
 
 		 650 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 926 aa  65.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 613 aa  65.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  32.59 
 
 		 746 aa  65.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2711  TonB-dependent receptor, plug  24.67 
 
 		 762 aa  65.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.882237  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1594  TonB-dependent receptor, plug  30.29 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>