More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1992 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 
671 aa  1366    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  36.99 
 
 
670 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  22.58 
 
 
678 aa  108  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  25.08 
 
 
680 aa  105  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.33 
 
 
640 aa  97.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 
710 aa  96.3  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.34 
 
 
635 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23.13 
 
 
653 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 
710 aa  89.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 
650 aa  88.6  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  32.16 
 
 
667 aa  87.4  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  21.96 
 
 
649 aa  87.4  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  34.51 
 
 
676 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  24.59 
 
 
665 aa  85.9  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 
679 aa  86.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  22.96 
 
 
663 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  22.96 
 
 
663 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  22.96 
 
 
659 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  22.96 
 
 
663 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  21.37 
 
 
705 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  22.76 
 
 
663 aa  84  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  22.76 
 
 
663 aa  84  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  35.03 
 
 
715 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 
715 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 
643 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  22.76 
 
 
663 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  38.35 
 
 
715 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.25 
 
 
641 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  29.94 
 
 
615 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  35.03 
 
 
704 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  28.43 
 
 
687 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  35.16 
 
 
642 aa  82.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  22.15 
 
 
650 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  22.15 
 
 
650 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  27.12 
 
 
650 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  22.15 
 
 
650 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  36.3 
 
 
670 aa  80.5  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  33.14 
 
 
662 aa  80.5  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  31.76 
 
 
656 aa  80.1  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  29.38 
 
 
718 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  34.03 
 
 
704 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  33.33 
 
 
650 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 
707 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  37.5 
 
 
702 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 
762 aa  78.2  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  35.17 
 
 
705 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 
804 aa  77  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  38.26 
 
 
616 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 
801 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  23.9 
 
 
652 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 
679 aa  77  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 
743 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 
661 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 
714 aa  75.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  32.09 
 
 
641 aa  75.5  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  35.22 
 
 
631 aa  75.5  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 
806 aa  75.5  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 
653 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 
649 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 
658 aa  73.9  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40.74 
 
 
630 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  40.74 
 
 
630 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0483  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  33.16 
 
 
271 aa  72.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00522803  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  30.23 
 
 
618 aa  72.8  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  36.48 
 
 
639 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0448  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  33.16 
 
 
271 aa  72.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  30.59 
 
 
655 aa  72  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 
648 aa  72.4  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.21 
 
 
615 aa  72  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 
904 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 
904 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 
649 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 
665 aa  71.2  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 
662 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  27.09 
 
 
617 aa  71.2  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
684 aa  70.5  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 
657 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.46 
 
 
656 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 
614 aa  70.5  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 
668 aa  70.1  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  39.82 
 
 
616 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  30.54 
 
 
737 aa  70.5  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 
611 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 
680 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 
681 aa  69.7  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 
659 aa  68.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 
764 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  21.55 
 
 
634 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 
662 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 
662 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 
904 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  38.76 
 
 
678 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 
647 aa  68.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  35.97 
 
 
1023 aa  68.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 
904 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2600  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 
856 aa  68.6  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  36.03 
 
 
704 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  36.03 
 
 
697 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  32.58 
 
 
653 aa  68.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.05 
 
 
631 aa  68.2  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>