More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0448 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0448  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0483  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00522803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  36.91 
 
 		 729 aa  188  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  38.4 
 
 		 861 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 769 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 701 aa  118  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  35.69 
 
 		 641 aa  116  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 649 aa  99  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 678 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 679 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 657 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 651 aa  96.3  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  30.12 
 
 		 650 aa  95.1  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 661 aa  93.6  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 746 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  32.65 
 
 		 647 aa  90.1  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  31.54 
 
 		 646 aa  89.7  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  35.19 
 
 		 663 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  35.19 
 
 		 659 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  35.19 
 
 		 663 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 663 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  35.19 
 
 		 663 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  35.19 
 
 		 663 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  35.19 
 
 		 663 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  31.34 
 
 		 732 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  34.97 
 
 		 641 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 665 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  35.56 
 
 		 656 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  35.75 
 
 		 623 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  30.86 
 
 		 656 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 653 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 903 aa  79.3  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  27.96 
 
 		 718 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  33.15 
 
 		 614 aa  79.3  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  35.17 
 
 		 650 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  35.17 
 
 		 650 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  35.42 
 
 		 650 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  35.17 
 
 		 650 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  35.42 
 
 		 650 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 634 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  32.29 
 
 		 659 aa  77  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 700 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  39.57 
 
 		 681 aa  76.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 715 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 615 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 699 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.08 
 
 		 619 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  35.12 
 
 		 1023 aa  75.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 635 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 613 aa  75.9  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 715 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  31.9 
 
 		 652 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 642 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 780 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 681 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 710 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  28.46 
 
 		 638 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 614 aa  73.9  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 806 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  36.67 
 
 		 646 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  28.74 
 
 		 676 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  32.18 
 
 		 655 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 726 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  35.09 
 
 		 665 aa  72.4  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  33.16 
 
 		 671 aa  72.8  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  34.84 
 
 		 713 aa  72.4  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 730 aa  72.4  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 688 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 697 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 732 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  29.65 
 
 		 680 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  30.29 
 
 		 680 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  30.45 
 
 		 726 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.17 
 
 		 653 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 724 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  34.46 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  28.82 
 
 		 906 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  31.48 
 
 		 704 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  30.43 
 
 		 617 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  34.1 
 
 		 665 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  41.18 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  34.1 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 696 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 684 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  34.1 
 
 		 665 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 678 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  35.77 
 
 		 647 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  35.15 
 
 		 614 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 		 619 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 795 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 883 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 883 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 743 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  39.69 
 
 		 646 aa  69.3  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 698 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 653 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 628 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  38.33 
 
 		 653 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>