More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4414 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
639 aa  1320    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  54.19 
 
 
650 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 
621 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2526  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 
620 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2071  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 
629 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00162344  hitchhiker  0.000156466 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 
602 aa  135  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 
634 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 
617 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 
670 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  25.72 
 
 
613 aa  117  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 
613 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 
642 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  23.03 
 
 
638 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  22.87 
 
 
655 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 
662 aa  111  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  24.54 
 
 
695 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.54 
 
 
639 aa  110  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.66 
 
 
616 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  22.91 
 
 
656 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 
619 aa  110  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.06 
 
 
631 aa  110  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 
613 aa  108  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 
628 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  26.22 
 
 
611 aa  107  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 
737 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  23.38 
 
 
623 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  24.25 
 
 
690 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  26 
 
 
682 aa  106  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 
627 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.46 
 
 
623 aa  105  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.56 
 
 
615 aa  104  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 
673 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 
618 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  24.43 
 
 
680 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  26.1 
 
 
651 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.82 
 
 
619 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  25 
 
 
657 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  22.87 
 
 
634 aa  100  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  36.16 
 
 
624 aa  100  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.12 
 
 
631 aa  100  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  34.95 
 
 
618 aa  99.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 
614 aa  99  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 
649 aa  99  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 
638 aa  97.8  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 
659 aa  97.8  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.74 
 
 
655 aa  97.8  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 
647 aa  96.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.92 
 
 
633 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  26 
 
 
680 aa  96.3  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  31.71 
 
 
646 aa  95.9  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 
698 aa  96.3  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.82 
 
 
615 aa  96.3  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 
648 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  43.51 
 
 
645 aa  94.7  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.29 
 
 
652 aa  94.7  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 
681 aa  94.4  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 
621 aa  94.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.25 
 
 
614 aa  94  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 
612 aa  94  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  37.16 
 
 
616 aa  94  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  23.69 
 
 
628 aa  94  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 
740 aa  94  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  26.58 
 
 
650 aa  94  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 
679 aa  93.6  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  33.16 
 
 
621 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 
627 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.2 
 
 
614 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 
651 aa  92  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 
632 aa  91.7  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25 
 
 
614 aa  91.3  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25 
 
 
614 aa  91.3  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 
627 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  38.24 
 
 
655 aa  90.9  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  36.53 
 
 
623 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23.63 
 
 
653 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 
629 aa  90.5  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.92 
 
 
1023 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  25.74 
 
 
700 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.6 
 
 
614 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  22.46 
 
 
671 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  25.2 
 
 
623 aa  90.1  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 
624 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25 
 
 
635 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 
602 aa  89.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.62 
 
 
630 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  21.05 
 
 
620 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 
615 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 
611 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.62 
 
 
630 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  39.88 
 
 
326 aa  89  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 
667 aa  88.6  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 
649 aa  88.6  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 
648 aa  88.2  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  36.18 
 
 
617 aa  88.2  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  22.48 
 
 
652 aa  88.6  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  33.73 
 
 
614 aa  88.2  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 
653 aa  87.8  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 
665 aa  87.8  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1260  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 
581 aa  87.4  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  34.02 
 
 
617 aa  87.8  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>