More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0123 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 670 aa  1372    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  36.99 
 
 		 671 aa  372  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 715 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  33.49 
 
 		 670 aa  103  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3833  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.5 
 
 		 667 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  33.48 
 
 		 702 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 681 aa  99.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  32 
 
 		 705 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 649 aa  97.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3494  TonB-dependent receptor plug  38.98 
 
 		 715 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  22.85 
 
 		 680 aa  94.7  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 710 aa  94  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4209  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 707 aa  94  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1697  TonB-dependent receptor, plug  37.85 
 
 		 704 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3742  TonB-dependent receptor plug  37.85 
 
 		 715 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4171  hypothetical protein  37.29 
 
 		 704 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.05 
 
 		 639 aa  90.1  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  35.76 
 
 		 642 aa  90.1  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 643 aa  88.2  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 		 679 aa  87.8  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  34.87 
 
 		 676 aa  87.8  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  21.86 
 
 		 678 aa  87.4  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 665 aa  87  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.27 
 
 		 656 aa  86.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  33.56 
 
 		 718 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 684 aa  86.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 764 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.78 
 
 		 640 aa  84.3  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 714 aa  84  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  28.5 
 
 		 615 aa  84  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.35 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.64 
 
 		 641 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 662 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.35 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 649 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.35 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.35 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 650 aa  82.4  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 649 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 657 aa  81.3  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 635 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  22.98 
 
 		 663 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  23.5 
 
 		 700 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  22.62 
 
 		 659 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 648 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  21.83 
 
 		 633 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  31.37 
 
 		 662 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3002  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 668 aa  79  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.957092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 662 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.08 
 
 		 650 aa  77.4  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  30.88 
 
 		 653 aa  77  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 729 aa  77  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  23.08 
 
 		 650 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  24.21 
 
 		 650 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  23.03 
 
 		 650 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.08 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 893 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 680 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 724 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1362  TonB-dependent receptor, plug  28.52 
 
 		 737 aa  76.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0352862  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 641 aa  75.5  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  22.69 
 
 		 746 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 662 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 661 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  22.99 
 
 		 724 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 688 aa  75.1  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 817 aa  74.3  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 710 aa  74.3  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  23.17 
 
 		 703 aa  74.3  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  21.75 
 
 		 679 aa  74.3  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  22.99 
 
 		 724 aa  73.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 757 aa  73.2  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  22.99 
 
 		 724 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0769  TonB-dependent receptor, plug  34.13 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31 
 
 		 630 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31 
 
 		 630 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 624 aa  72  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 754 aa  72  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  35.38 
 
 		 722 aa  71.6  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 653 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 727 aa  71.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 611 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0777  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  22.55 
 
 		 746 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  33.71 
 
 		 652 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  35.34 
 
 		 704 aa  70.9  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 616 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 731 aa  70.5  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  35.82 
 
 		 705 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 740 aa  70.5  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 697 aa  70.5  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  22.84 
 
 		 724 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 671 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 613 aa  69.3  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 647 aa  69.3  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  21.91 
 
 		 666 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  22.69 
 
 		 724 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 762 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>