More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0492 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 762 aa  1559    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  45.79 
 
 		 737 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  44.85 
 
 		 742 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  45.49 
 
 		 742 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  41.3 
 
 		 736 aa  552  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 719 aa  389  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 764 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 761 aa  208  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 778 aa  194  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 778 aa  193  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 778 aa  193  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 778 aa  193  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 778 aa  193  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 778 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 778 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 778 aa  188  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 796 aa  183  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 784 aa  180  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  24.86 
 
 		 790 aa  177  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 790 aa  177  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 874 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 760 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 784 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 788 aa  174  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 794 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 786 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 804 aa  173  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  25.33 
 
 		 779 aa  170  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 772 aa  170  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 772 aa  170  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 788 aa  162  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 782 aa  160  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  25.1 
 
 		 780 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 836 aa  145  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 702 aa  137  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 845 aa  128  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 683 aa  128  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 815 aa  126  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  24.29 
 
 		 661 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 821 aa  124  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 674 aa  121  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 670 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  43.06 
 
 		 613 aa  118  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 714 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 707 aa  114  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 718 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 661 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  44.59 
 
 		 665 aa  112  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.71 
 
 		 631 aa  110  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 662 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 649 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 649 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.71 
 
 		 631 aa  103  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 698 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  22.43 
 
 		 769 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  42.03 
 
 		 681 aa  103  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.57 
 
 		 631 aa  103  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 699 aa  100  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 698 aa  100  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 732 aa  98.2  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 701 aa  97.8  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  36.87 
 
 		 633 aa  97.8  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  39.55 
 
 		 634 aa  96.3  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  41.86 
 
 		 659 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  26.26 
 
 		 807 aa  95.9  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  40.15 
 
 		 639 aa  95.5  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  40.88 
 
 		 806 aa  95.5  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  41.86 
 
 		 663 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  41.86 
 
 		 663 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  36.98 
 
 		 1023 aa  95.1  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  41.86 
 
 		 663 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  41.86 
 
 		 663 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  41.86 
 
 		 663 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 663 aa  95.1  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  41.86 
 
 		 663 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  41.86 
 
 		 641 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  41.73 
 
 		 631 aa  94.7  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  41.86 
 
 		 650 aa  94.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  41.5 
 
 		 732 aa  95.1  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  41.22 
 
 		 650 aa  94.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  41.22 
 
 		 650 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  41.86 
 
 		 650 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  41.22 
 
 		 650 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.44 
 
 		 646 aa  94.4  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  22.56 
 
 		 647 aa  94.4  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 643 aa  94.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 734 aa  94  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.86 
 
 		 615 aa  94  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.18 
 
 		 615 aa  93.2  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  34.43 
 
 		 638 aa  92  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  41.22 
 
 		 656 aa  92  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  38.46 
 
 		 668 aa  92  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  39.85 
 
 		 653 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  39.85 
 
 		 635 aa  92  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 669 aa  91.7  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  39.47 
 
 		 698 aa  91.3  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  38.52 
 
 		 634 aa  90.9  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 733 aa  90.9  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  34.38 
 
 		 718 aa  90.9  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  36.84 
 
 		 646 aa  90.5  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>