More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1481 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  49.06 
 
 		 685 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  66.18 
 
 		 683 aa  923    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 674 aa  1390    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  47.35 
 
 		 675 aa  628  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  39.79 
 
 		 675 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  41.36 
 
 		 668 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 657 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  40.21 
 
 		 654 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  37.9 
 
 		 682 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  36.64 
 
 		 708 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  36.87 
 
 		 731 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  36.87 
 
 		 731 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 667 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 716 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 693 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 744 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 697 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 718 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 656 aa  363  4e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 663 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 727 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 728 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 656 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.92 
 
 		 653 aa  244  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 690 aa  220  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 678 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 651 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 665 aa  157  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 669 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 762 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 737 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 742 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  21.42 
 
 		 661 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  21.54 
 
 		 666 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  21.54 
 
 		 666 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  21.54 
 
 		 666 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  21.54 
 
 		 666 aa  94  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.46 
 
 		 646 aa  92  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 736 aa  91.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 709 aa  90.9  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  20.98 
 
 		 649 aa  89.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 642 aa  89.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  21.47 
 
 		 639 aa  89.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  20.28 
 
 		 666 aa  87.8  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 653 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  23.98 
 
 		 807 aa  87.8  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  21.52 
 
 		 663 aa  87  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  21.84 
 
 		 746 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  23.18 
 
 		 612 aa  84.3  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  20.98 
 
 		 650 aa  84  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  20.87 
 
 		 762 aa  83.2  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.14 
 
 		 775 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  21.98 
 
 		 731 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 699 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 714 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1978  TonB-dependent receptor plug  22.48 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.500779  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 719 aa  81.3  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  20.03 
 
 		 677 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  27.88 
 
 		 652 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 742 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 702 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 698 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  20.7 
 
 		 663 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  20.84 
 
 		 656 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  22.64 
 
 		 656 aa  78.6  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  20.96 
 
 		 746 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 683 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  23.27 
 
 		 725 aa  77.4  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  23.01 
 
 		 698 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 		 658 aa  76.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.03 
 
 		 676 aa  77  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.71 
 
 		 633 aa  74.3  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 626 aa  73.9  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 828 aa  73.9  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  24.24 
 
 		 779 aa  73.9  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.47 
 
 		 650 aa  73.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.16 
 
 		 650 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  24.12 
 
 		 732 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 673 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  26.19 
 
 		 653 aa  73.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  22.27 
 
 		 774 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.16 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  25.37 
 
 		 671 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 695 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 809 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  24.84 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  24.91 
 
 		 741 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.08 
 
 		 774 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  30.23 
 
 		 677 aa  70.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  24.84 
 
 		 650 aa  70.5  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  23.93 
 
 		 707 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 737 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  21.92 
 
 		 634 aa  70.5  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 749 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 767 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 715 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25.24 
 
 		 656 aa  70.5  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>