More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0252 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  62.35 
 
 		 656 aa  859    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 663 aa  1378    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  37.25 
 
 		 654 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  34.78 
 
 		 682 aa  381  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  35.13 
 
 		 675 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 683 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 685 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 674 aa  362  9e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 668 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 744 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 657 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 675 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 667 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 731 aa  306  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 731 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 708 aa  303  7.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 716 aa  300  6e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 693 aa  290  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 697 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 656 aa  274  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 728 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 727 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 718 aa  260  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 690 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.54 
 
 		 653 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  23.36 
 
 		 678 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 665 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 627 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 742 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 662 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 669 aa  105  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 		 651 aa  104  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  21.65 
 
 		 677 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 641 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 762 aa  95.5  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  21.51 
 
 		 661 aa  92  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 688 aa  92.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 736 aa  92  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  22.77 
 
 		 663 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  20.63 
 
 		 707 aa  90.9  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.61 
 
 		 666 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 709 aa  90.5  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  22.61 
 
 		 666 aa  90.5  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.61 
 
 		 666 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 767 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 737 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  28.24 
 
 		 729 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  28.24 
 
 		 741 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  22.47 
 
 		 666 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  27.92 
 
 		 707 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 749 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  22.07 
 
 		 666 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  21.94 
 
 		 652 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.32 
 
 		 639 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  21.69 
 
 		 649 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  21.29 
 
 		 650 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.54 
 
 		 614 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.67 
 
 		 614 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  22.69 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  22.59 
 
 		 628 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 715 aa  81.3  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.52 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.52 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.38 
 
 		 614 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  22.47 
 
 		 623 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 699 aa  79.7  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 632 aa  79.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 737 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.75 
 
 		 630 aa  78.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  21.79 
 
 		 727 aa  77.8  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  28.62 
 
 		 735 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.34 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 686 aa  75.5  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  22.16 
 
 		 617 aa  74.7  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 634 aa  74.3  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 695 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1260  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 581 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 809 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  21.69 
 
 		 774 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 682 aa  71.2  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 628 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.65 
 
 		 647 aa  71.2  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1019  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 572 aa  70.9  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.463707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.01 
 
 		 631 aa  70.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  21.56 
 
 		 774 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  21.56 
 
 		 774 aa  70.5  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  21.69 
 
 		 774 aa  70.5  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  21.56 
 
 		 774 aa  70.5  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 635 aa  70.5  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  25.79 
 
 		 809 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 809 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  21.11 
 
 		 681 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 809 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  21.07 
 
 		 706 aa  68.6  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  21.06 
 
 		 679 aa  68.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  21.72 
 
 		 617 aa  68.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1978  TonB-dependent receptor plug  22.17 
 
 		 663 aa  68.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.500779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 1128 aa  68.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.75 
 
 		 631 aa  67.8  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 698 aa  67  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>