More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0909 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  46.88 
 
 		 778 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  46.75 
 
 		 778 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  47.18 
 
 		 779 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  47.99 
 
 		 772 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  46.88 
 
 		 778 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  89.45 
 
 		 804 aa  1422    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  46.75 
 
 		 778 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  47.07 
 
 		 784 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  47.4 
 
 		 788 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  46.88 
 
 		 778 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  47.11 
 
 		 778 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 794 aa  1628    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  47.89 
 
 		 786 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  48.28 
 
 		 790 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  46.88 
 
 		 778 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  46.23 
 
 		 784 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  46.88 
 
 		 778 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  48.28 
 
 		 790 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  47.99 
 
 		 772 aa  675    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  48.41 
 
 		 788 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  40.31 
 
 		 760 aa  547  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  42.03 
 
 		 821 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 761 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  35.81 
 
 		 796 aa  428  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 782 aa  389  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  32.63 
 
 		 780 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 874 aa  343  5.999999999999999e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 718 aa  328  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 742 aa  206  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 737 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 719 aa  196  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 762 aa  180  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 742 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 736 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 764 aa  161  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 702 aa  87.8  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  23.6 
 
 		 746 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 714 aa  85.9  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 796 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 796 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  23.6 
 
 		 746 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 796 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.27 
 
 		 706 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 796 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 705 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 792 aa  78.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 653 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 720 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 709 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 635 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  26.74 
 
 		 744 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 795 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  26.74 
 
 		 744 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  26.36 
 
 		 746 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 778 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  26.36 
 
 		 744 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 795 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.83 
 
 		 696 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.83 
 
 		 696 aa  73.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 613 aa  72.8  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.4 
 
 		 713 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  22.71 
 
 		 769 aa  72  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25.91 
 
 		 653 aa  72  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 822 aa  71.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.94 
 
 		 713 aa  71.2  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 		 733 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 679 aa  70.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 698 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 698 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  26.71 
 
 		 807 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 743 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  23.6 
 
 		 703 aa  70.5  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 698 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.49 
 
 		 695 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 678 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  21.47 
 
 		 710 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 757 aa  69.3  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  26.92 
 
 		 697 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 657 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  23.48 
 
 		 724 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 713 aa  68.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  23.38 
 
 		 740 aa  69.3  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 733 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  21.82 
 
 		 706 aa  68.2  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  21.95 
 
 		 656 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 733 aa  68.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  22.77 
 
 		 724 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  23.35 
 
 		 724 aa  67.4  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1662  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 686 aa  67.4  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.917445  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  23.35 
 
 		 724 aa  67.4  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 719 aa  67.4  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  23.35 
 
 		 724 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.82 
 
 		 724 aa  67.4  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.63 
 
 		 663 aa  67  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 850 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 781 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 821 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 754 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 702 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>