More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0256 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  100 
 
 		 807 aa  1646    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  55.75 
 
 		 828 aa  914    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  59.54 
 
 		 828 aa  1011    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  55.9 
 
 		 845 aa  918    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  62.58 
 
 		 815 aa  986    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  62.51 
 
 		 836 aa  1074    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 747 aa  198  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 737 aa  165  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 742 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 736 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 764 aa  120  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  25.57 
 
 		 848 aa  112  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.06 
 
 		 653 aa  111  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 760 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 709 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 776 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 683 aa  108  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  23.12 
 
 		 748 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 648 aa  104  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 699 aa  104  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  23.15 
 
 		 795 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.96 
 
 		 639 aa  102  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  21.02 
 
 		 668 aa  102  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 714 aa  101  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 654 aa  100  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 674 aa  99  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 657 aa  97.8  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 742 aa  96.3  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 763 aa  96.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 762 aa  95.5  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  23.16 
 
 		 812 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 783 aa  95.5  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 702 aa  94  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  26.67 
 
 		 656 aa  94.4  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 719 aa  93.6  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  26.81 
 
 		 659 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.76 
 
 		 726 aa  91.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  24.4 
 
 		 712 aa  90.9  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 710 aa  90.9  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  26.19 
 
 		 663 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 663 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26.19 
 
 		 641 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  26.19 
 
 		 663 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 918 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  26.19 
 
 		 663 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  26.19 
 
 		 663 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.89 
 
 		 650 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  26.19 
 
 		 663 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 659 aa  89.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.6 
 
 		 650 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.31 
 
 		 675 aa  89  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.6 
 
 		 650 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 807 aa  88.6  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.6 
 
 		 650 aa  88.6  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.58 
 
 		 833 aa  88.2  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 791 aa  88.2  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 642 aa  87.8  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 778 aa  87.8  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 780 aa  87.8  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 815 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.6 
 
 		 650 aa  87.4  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 757 aa  86.7  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 754 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 789 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 763 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 705 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  22.61 
 
 		 751 aa  85.1  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  27.16 
 
 		 623 aa  84.7  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 		 675 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 613 aa  84.7  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  22.54 
 
 		 751 aa  84.7  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  23.62 
 
 		 746 aa  84.3  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  22.45 
 
 		 751 aa  84.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 991 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  22.48 
 
 		 751 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 731 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  22.31 
 
 		 751 aa  83.2  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1066 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  22.28 
 
 		 767 aa  82.8  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 715 aa  83.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 791 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  22.15 
 
 		 759 aa  82.4  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 1001 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 861 aa  82.4  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1147 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 733 aa  82.4  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 772 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.08 
 
 		 695 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 661 aa  82  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 854 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 1021 aa  81.6  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 714 aa  81.3  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 673 aa  81.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  22.08 
 
 		 693 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.71 
 
 		 646 aa  80.9  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 708 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 761 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 866 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  22.84 
 
 		 788 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  22.32 
 
 		 676 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.332086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>