More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3179 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 788 aa  1605    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  37.12 
 
 		 960 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3315  TonB-dependent receptor, plug  31.41 
 
 		 781 aa  327  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 798 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 792 aa  314  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  29.58 
 
 		 782 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 791 aa  297  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  30.15 
 
 		 767 aa  285  3.0000000000000004e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  29.19 
 
 		 799 aa  283  8.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  29.96 
 
 		 797 aa  277  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 763 aa  275  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 772 aa  271  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1117 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 713 aa  247  8e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 823 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 795 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 760 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  28.86 
 
 		 750 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  27.27 
 
 		 803 aa  93.6  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 747 aa  91.3  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 748 aa  91.3  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 753 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 737 aa  88.6  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 776 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 882 aa  87  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 757 aa  85.5  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 597 aa  84.7  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  27.88 
 
 		 613 aa  84  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 866 aa  84  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  31.41 
 
 		 661 aa  80.9  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 759 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 783 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 919 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 836 aa  79.7  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 735 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 828 aa  79  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 721 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1175 aa  78.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 972 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 679 aa  78.2  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 818 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 1004 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25.96 
 
 		 833 aa  77.8  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 962 aa  77.4  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1008 aa  77.4  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  27.38 
 
 		 808 aa  77  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 793 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 1001 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 1089 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  29.1 
 
 		 809 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 917 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.29 
 
 		 848 aa  75.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 833 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 807 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 812 aa  75.1  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 782 aa  75.1  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 666 aa  75.1  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 664 aa  75.1  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 924 aa  74.7  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 673 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 888 aa  74.7  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 668 aa  74.7  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1147 aa  74.3  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 775 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 778 aa  73.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  26.15 
 
 		 1065 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 791 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  26.5 
 
 		 726 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 795 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1040 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 780 aa  71.2  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1068 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 942 aa  71.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 958 aa  71.2  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 751 aa  71.2  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 874 aa  71.2  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 810 aa  71.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  22.7 
 
 		 659 aa  70.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.9 
 
 		 646 aa  70.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 618 aa  70.9  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 933 aa  70.9  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 845 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  26.98 
 
 		 651 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 702 aa  70.5  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1085 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 1081 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  29.92 
 
 		 993 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 621 aa  70.5  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 769 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 776 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 763 aa  70.1  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5776  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 779 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 1090 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  24.18 
 
 		 807 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 653 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1103 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1082 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.21 
 
 		 631 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  26.16 
 
 		 800 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>