More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1339 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 714 aa  1479    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  36.83 
 
 		 673 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  35.85 
 
 		 671 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 690 aa  365  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 695 aa  363  8e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  35.86 
 
 		 662 aa  356  8.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 		 655 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  35.74 
 
 		 656 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 692 aa  346  8.999999999999999e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  33.28 
 
 		 680 aa  343  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 642 aa  295  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 634 aa  286  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.28 
 
 		 646 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  29.66 
 
 		 638 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 659 aa  253  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 670 aa  237  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 634 aa  232  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  28.79 
 
 		 671 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  28.53 
 
 		 623 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  26.57 
 
 		 613 aa  198  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 625 aa  191  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 682 aa  191  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 641 aa  177  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 602 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  26.03 
 
 		 638 aa  170  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 645 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 634 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 632 aa  161  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 618 aa  160  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  26.64 
 
 		 617 aa  159  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  26.19 
 
 		 614 aa  157  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 615 aa  154  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 626 aa  150  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 626 aa  148  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 735 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.92 
 
 		 630 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  25.56 
 
 		 628 aa  146  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.61 
 
 		 631 aa  145  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 737 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 655 aa  144  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 614 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 597 aa  141  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 614 aa  140  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 635 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 640 aa  136  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 638 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 698 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  25.77 
 
 		 631 aa  134  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.92 
 
 		 631 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 627 aa  134  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 642 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.52 
 
 		 613 aa  134  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 616 aa  134  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  24.41 
 
 		 611 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 628 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 620 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 632 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 624 aa  130  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 642 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.54 
 
 		 1023 aa  130  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.31 
 
 		 619 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 624 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 642 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 642 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 642 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 647 aa  127  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 611 aa  124  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  24.42 
 
 		 732 aa  124  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 613 aa  124  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1684  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 668 aa  123  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  23.37 
 
 		 622 aa  120  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.56 
 
 		 616 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  25.47 
 
 		 685 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  25.47 
 
 		 685 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 613 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  25.47 
 
 		 685 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  25.69 
 
 		 645 aa  118  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 638 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 641 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  25.47 
 
 		 685 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 709 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 621 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.46 
 
 		 616 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  25.16 
 
 		 685 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  25.16 
 
 		 821 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  25.04 
 
 		 685 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 593 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  21.66 
 
 		 628 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  24.74 
 
 		 623 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 629 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  23.79 
 
 		 640 aa  111  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  23.21 
 
 		 627 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 627 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  25.19 
 
 		 621 aa  110  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 653 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  23.66 
 
 		 647 aa  108  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 627 aa  107  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  24.18 
 
 		 623 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  24.48 
 
 		 680 aa  106  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>