More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0151 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  100 
 
 		 675 aa  1394    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  56.41 
 
 		 685 aa  762    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  49.78 
 
 		 683 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  47.64 
 
 		 674 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  43.73 
 
 		 675 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  44.48 
 
 		 657 aa  555  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  45.82 
 
 		 668 aa  518  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  42.44 
 
 		 654 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  42.41 
 
 		 667 aa  485  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  39.63 
 
 		 693 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  38.12 
 
 		 682 aa  429  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  36.51 
 
 		 731 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 731 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 708 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 656 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  35.57 
 
 		 716 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  35.13 
 
 		 663 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 744 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  35.25 
 
 		 697 aa  369  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 718 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 727 aa  356  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 656 aa  346  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 728 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.05 
 
 		 653 aa  266  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 690 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 678 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 651 aa  200  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 665 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 669 aa  154  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 613 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 707 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.4 
 
 		 646 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 709 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  21.4 
 
 		 677 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 705 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  21.55 
 
 		 836 aa  107  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  21.68 
 
 		 639 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1978  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 663 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.500779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 679 aa  100  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 653 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  30.21 
 
 		 729 aa  88.2  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  30.57 
 
 		 741 aa  88.2  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 668 aa  88.2  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 737 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 767 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  31.34 
 
 		 707 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 749 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 698 aa  87.4  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 635 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  21.9 
 
 		 656 aa  85.1  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  22.12 
 
 		 659 aa  84.7  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 695 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 571 aa  84.7  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  23.23 
 
 		 807 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  21.28 
 
 		 663 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  22.28 
 
 		 663 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  22.28 
 
 		 663 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1128 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 		 689 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 742 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 815 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 695 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 740 aa  78.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  21.99 
 
 		 751 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  21.86 
 
 		 751 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  21.99 
 
 		 751 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  26.63 
 
 		 761 aa  78.2  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  22.05 
 
 		 751 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  22.05 
 
 		 751 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  22.06 
 
 		 641 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  21.93 
 
 		 676 aa  77.8  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 737 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  21.48 
 
 		 627 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.38 
 
 		 859 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 634 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  33.62 
 
 		 677 aa  76.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  21.04 
 
 		 634 aa  75.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 730 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1524  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 605 aa  75.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  22.06 
 
 		 740 aa  75.5  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 657 aa  75.5  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 671 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.25 
 
 		 861 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 699 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 678 aa  74.7  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  27.3 
 
 		 647 aa  74.3  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 701 aa  73.9  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 719 aa  73.9  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  20.12 
 
 		 633 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 634 aa  73.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  23.98 
 
 		 699 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  27.93 
 
 		 650 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 662 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 713 aa  73.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  22.46 
 
 		 613 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  21.98 
 
 		 647 aa  72  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 648 aa  72.4  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  20.9 
 
 		 642 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.48 
 
 		 663 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  20.9 
 
 		 642 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>