More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1968 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  62.8 
 
 
845 aa  1069    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  55.22 
 
 
807 aa  909    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  59.66 
 
 
815 aa  974    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  100 
 
 
828 aa  1691    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  60.33 
 
 
836 aa  1055    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  65.31 
 
 
828 aa  1151    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 
747 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.59 
 
 
653 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  22.48 
 
 
769 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 
776 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 
757 aa  123  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 
737 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 
795 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  23.67 
 
 
861 aa  120  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  23.8 
 
 
748 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 
648 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 
760 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 
657 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 
714 aa  110  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 
764 aa  110  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 
753 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 
742 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 
709 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  29.05 
 
 
833 aa  103  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 
1075 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 
757 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  23.01 
 
 
812 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 
791 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 
809 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 
833 aa  102  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 
759 aa  101  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
1147 aa  101  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 
780 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  24.96 
 
 
693 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.62 
 
 
640 aa  100  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 
679 aa  99.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 
791 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  27.31 
 
 
750 aa  97.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 
763 aa  96.3  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 
920 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 
705 aa  94.4  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 
793 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 
1004 aa  93.6  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 
744 aa  94  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 
893 aa  93.6  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 
791 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 
778 aa  92.8  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 
705 aa  92.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 
742 aa  92.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.26 
 
 
656 aa  92.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  28.38 
 
 
848 aa  92  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 
1001 aa  92  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.69 
 
 
701 aa  92  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 
1066 aa  91.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  21.36 
 
 
692 aa  91.7  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 
798 aa  91.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.42 
 
 
726 aa  91.3  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 
1085 aa  91.3  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 
767 aa  90.9  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 
698 aa  90.9  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  22.58 
 
 
789 aa  90.9  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 
897 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 
809 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 
1127 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 
957 aa  89.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 
801 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 
657 aa  88.6  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 
707 aa  88.2  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  23 
 
 
683 aa  88.2  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  26.47 
 
 
782 aa  87.8  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 
762 aa  87.4  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 
668 aa  87.4  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 
654 aa  87  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  28.15 
 
 
799 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 
761 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  27.66 
 
 
788 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  22.95 
 
 
680 aa  87  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 
882 aa  86.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3725  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 
918 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0163504  normal  0.0922435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 
888 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.36 
 
 
650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  24.2 
 
 
650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.36 
 
 
650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 
1020 aa  86.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  22.77 
 
 
715 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 
675 aa  85.9  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 
1040 aa  85.9  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  22.21 
 
 
681 aa  85.5  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.07 
 
 
650 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 
772 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  26.63 
 
 
942 aa  85.1  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 
765 aa  85.1  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 
662 aa  85.1  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 
917 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  27.2 
 
 
914 aa  85.1  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 
686 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 
854 aa  84.3  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 
785 aa  84.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  22.65 
 
 
683 aa  84.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  24.78 
 
 
650 aa  84.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>