More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2310 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  92.42 
 
 		 836 aa  1498    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  62.58 
 
 		 807 aa  969    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  68.9 
 
 		 828 aa  1106    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  59.66 
 
 		 828 aa  979    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  67.75 
 
 		 845 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 815 aa  1665    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 762 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  35.44 
 
 		 747 aa  127  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 764 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.54 
 
 		 653 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 654 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 795 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 709 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 736 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 679 aa  108  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  23.65 
 
 		 833 aa  105  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25.48 
 
 		 656 aa  105  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 776 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.55 
 
 		 726 aa  103  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 861 aa  103  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 699 aa  103  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.68 
 
 		 639 aa  99.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 715 aa  99  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 675 aa  98.6  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 744 aa  97.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 668 aa  96.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  24.51 
 
 		 650 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  24.23 
 
 		 650 aa  95.1  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.36 
 
 		 659 aa  95.1  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  24.23 
 
 		 650 aa  95.1  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  23.11 
 
 		 789 aa  94.7  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  24.23 
 
 		 650 aa  94  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  23.96 
 
 		 650 aa  93.2  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 700 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.53 
 
 		 663 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 663 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  22.93 
 
 		 848 aa  92.4  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.53 
 
 		 663 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.53 
 
 		 663 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.53 
 
 		 641 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.53 
 
 		 663 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  23.53 
 
 		 663 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 742 aa  92.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  23.28 
 
 		 806 aa  91.7  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 730 aa  91.3  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 700 aa  91.3  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 700 aa  91.3  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 		 807 aa  91.3  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 757 aa  90.1  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  21.51 
 
 		 739 aa  90.5  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.09 
 
 		 700 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 700 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.09 
 
 		 700 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 700 aa  89  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 653 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 735 aa  88.6  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 700 aa  89  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 613 aa  88.2  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 778 aa  88.2  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 731 aa  87.8  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 780 aa  87.8  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 748 aa  87.4  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  23.26 
 
 		 710 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 855 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 710 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 678 aa  86.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 737 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 761 aa  85.5  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 705 aa  85.1  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 680 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  21.31 
 
 		 788 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  21.12 
 
 		 690 aa  83.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.12 
 
 		 675 aa  84  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.06 
 
 		 701 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 798 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 731 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 686 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 700 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 731 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 635 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.32 
 
 		 861 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.8 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.39 
 
 		 646 aa  81.6  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.8 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.8 
 
 		 666 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  23.16 
 
 		 693 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  22.47 
 
 		 812 aa  81.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  19.66 
 
 		 667 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 801 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.8 
 
 		 666 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 760 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 706 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 683 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.8 
 
 		 695 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.51 
 
 		 666 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 783 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.8 
 
 		 663 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 753 aa  79.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 742 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>